Αν και το χρηματοδοτούμενο από την ΕΕ Νοτιοανατολικό Ευρωπαϊκό Πανεπιστήμιο άνοιξε το 2002 σε μια προσπάθεια να λύσει το εκπαιδευτικό πρόβλημα που αντιμετώπιζαν οι Αλβανοί, είναι ιδιωτικό ίδρυμα.
Иако Универзитетот на Југоисточна Европа финансиран од страна на ЕУ беше отворен во 2002 година во обид да се реши образовниот проблем со кој се соочија етничките Албанци, тој претставува приватна институција.