Σύμφωνα με το κατηγορητήριο εναντίον του, ο Γκοτοβίνα ήταν ο γενικός διοικητής της Επιχείρησης Καταιγίδα στο νότιο τμήμα της περιοχή Κράινα.
Според обвинението, Готовина бил командант на севкупните дејства од операцијата „Бура“ во јужниот дел од регионот на Краина.