Τον Μάρτιο του 1966, ο Τούντζμαν, που ήταν ο πρώτος πρόεδρος της Κροατίας τότε, διόρισε τον Γκοτόβινα αρχηγό της Επιθεώρησης του κροατικού στρατού.
Во март 1996 година Туѓман, кој беше претседател на Хрватска во тоа време, го назначил Готовина за шеф на Хрватскиот армиски инспекторат.