Το Διεθνές Ποινικό Δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία (ICTY) δίωξε τον Χαραντινάι για 37 εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας και παραβιάσεις των νόμων ή θεσμών του πολέμου, κατηγορώντας τον για ανάμιξη σε δίωξη, δολοφονία, βιασμό και άλλες αγριότητες που διεπράχθησαν στο Κοσσυφοπέδιο κατά τη διάρκεια της σύγκρουσης του 1998-1999.
Меѓународниот кривичен трибунал за поранешна Југославија (МКТЈ) го обвини Харадинај по 37 точки од обвинението за злосторства против човештвото и прекршување на законите и обичаите на војувањето, извршени за време на конфликтот во периодот 1998 до 1999 година во Косово.