Όταν ανακοίνωσε την απόσυρσή του από την πολιτική, στις 19 Ιουλίου 1996, ο Κάρατζιτς άρχισε να κρύβεται και κατάφερε να αποφύγει το δίχτυ της δικαιοσύνης για πολλά χρόνια, παρά τις πολυάριθμες απόπειρες των κυανοκράνων να τον συλλάβουν.
По објавувањето на неговата оставка од политиката на 19-ти јули 1996 година Караџиќ почна да се крие, успевајќи со години да бега од правдата и покрај бројните обиди на мировниците на НАТО за негово апсење.