Επειδή ο στρατός θεωρείται ως ύστατος φύλακας του κοσμικού συστήματος της Τουρκίας, είχε μια δύσκολη σχέση με το κυβερνών Κόμμα Δικαιοσύνης και Ανάπτυξης (AKP) που είναι βαθιά ριζωμένο στο Ισλάμ.
Бидејќи војската се смета себеси за краен чувар на турскиот секуларен систем, истата има комплициран однос со исламистичката владејачка Партија на правдата и развојот (АКП).