Ο κρατικός έλεγχος εξασφαλίζεται μέσω μιας ενιαίας διοίκησης η οποία απορρέει από την Προεδρία της Β-Ε, μεταβιβάζεται στο Υπουργείο Άμυνας, κατόπιν στο Γενικό Επιτελείο και τους Διοικητές των Διοικήσεων Επιχειρήσεων και Υποστήριξης.
Државната контрола е обезбедена преку единствен синџир на команда кој поминува од претседателството на БиХ кон министерот за одбрана, потоа кон началниците на штабот и на крајот кон командите на оперативната и заштитната команда.