Εισαγγελείς του ΟΗΕ κατηγόρησαν τον Γκοτοβίνα το 2001, για εγκλήματα που προκύπτουν από το φερόμενο ρόλο του σε αγριότητες που διεπράχθησαν κατά τη διάρκεια επίθεσης του Κροατικού Στρατού το 1995 εναντίον Σέρβων αυτονομιστών στην περιοχή Κράινα.
Обвинението на ОН против Готовина од 2001 година се темели на обвиненијата во врска со неговата наводна улога во злосторствата извршени за време на офанзивата на хрватската армија во 1995 година против српските сепаратисти во областа Краина.