Το λιμενικό σώμα είναι οργανωμένο σε δύο σκέλη, το πολιτικό σκέλος το οποίο ελέγχεται από τον υπουργό εσωτερικών και το στρατιωτικό σκέλος το οποίο αποτελεί τμήμα του υπουργείου άμυνας – αυτά τα δύο θα συγχωνευτούν.
Крајбрежната стража работи под два сектори, цивилниот предводена од Министерството за внатрешни работи и воениот, кој е дел од Министерството за одбрана -- кои сега ќе се спојат.