Ο Μλάντιτς αρχικά κατηγορήθηκε για εγκλήματα πολέμου που προέρχονται από τη σύγκρουση στη Β&Ε τον Ιούλιο του 1995, υπό κοινό κατηγορητήριο με τον εν καιρώ πολέμου Σερβοβόσνιο πολιτικό ηγέτη Ράντοβαν Κάρατζιτς, αλλά αργότερα χωρίστηκε σε δύο χωριστές υποθέσεις.
Младиќ првично беше обвинет за воени злосторства во врска со конфликтот во БиХ во јули 1995 година, во заедничкото обвинение со политичкиот водач на босанските Срби, Радован Караџиќ, но истото подоцна беше поделено на два одделни случаи.