Την περίοδο της Επιχείρησης Καταιγίδα, ο Γκοτοβίνα ήταν διοικητής της Λειτουργικής Ζώνης Σπλιτ του Κροατικού Στρατού και ασκούσε πλήρη διοίκηση και έλεγχο σε όλες τις Κροατικές δυνάμεις που συμμετείχαν στην έφοδο.
Во времето на операцијата Бура, Готовина беше командант на Сплитската оперативна зона на хрватската армија и имаше целосна команда и контрола над сите хрватски сили што учествуваа во офанзивата.