Ο Κάραζιτς, μαζί με το στρατιωτικό διοικητή του Ράτκο Μλάντιτς, καταζητούνται από το Διεθνές Ποινικό Δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία (ICTY).
Караџиќ, заедно со неговиот воен командант Ратко Младиќ, е обвинет од страна на Меѓународниот кривичен трибунал за поранешна Југославија (МКТЈ).