Κατά τις δυο θητείες του Γκλιγκόροφ στο αξίωμα του προέδρου, μεταξύ 1991 και 1999, η πΓΔΜ αποτέλεσε μέλος του ΟΗΕ υπό την προσωρινή ονομασία "πρώην Γιουγκοσλαβική Δημοκρατία της Μακεδονίας", έκανε δεκτό το Προσωρινό Σύμφωνο του 1995 με την Ελλάδα και υποβλήθηκε σε αμφιλεγόμενη οικονομική μετάβαση.
За време на двата мандати на Глигоров како претседател, меѓу 1991 и 1999 година, Македонија стана членка на ОН, под привремената референца „поранешна југословенска република Македонија“, ја прифати Привремената спогодба од 1995 година со Грција и помина низ контроверзна економска транзиција.