Υπάρχει μεγάλη αντιπαράθεση σχετικά με την παράδοση του Μιλόσεβιτς στο δικαστήριο της Χάγης, στο οποίο εναντιώθηκε ο Κοστούνιτσα, καθώς επίσης για τη συνεργασία με το δικαστήριο.
Имаше голем конфликт околу предавањето на Милошевиќ на Хашкиот трибунал, на што Коштуница се спротивстави, заедно со соработката со Трибуналот.