Αυτό που περιπλέκει τη θέση του στρατού είναι η τρέχουσα εξέταση της υπόθεσης Εργκένεκον, που έχει οδηγήσει την αστυνομία να έχει θέσει υπό κράτηση σχεδόν 200 υπόπτους, συμπεριλαμβανομένων συνταξιούχων στρατηγών και εν ενεργεία στρατιωτικούς, για ισχυρισμούς συνωμοσίας κατά της κυβέρνησης AKP.
Истрагата за Ергенекон уште повеќе ја компликува позицијата на војската, која доведе до тоа полицијата да приведе скоро 200 осомничени, вклучително и пензионирани генерали и активни војници, за наводен заговор против владата на АКП.