Ο Γκοτόβινα αντιμετωπίζει τέσσερις κατηγορίες για εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας και τρεις κατηγορίες παραβιάσεων κανόνων και ηθών πολέμου σε σχέση με τις επιχειρήσεις του κροατικού στρατεύματος, που έφεραν τον κωδικό «Επιχείρηση Καταιγίδα», για την ανακατάληψη, από τους σέρβους αντάρτες, της περιοχής Κραϊίνα.
Готовина се соочува со четири точки во обвинението за злосторства против човештвото и три прекршувања на законите или обичаите на војната во врска со офанзивата на хрватската армија, кодирана како операција Бура, за преземање на Краина од српските бунтовници.