Η ISAF πραγματοποιεί περιπολίες σε διάφορες αστυνομικές περιφέρειες και τελεί υπό τις εντολές τριών διοικήσεων: το βόρειο αρχηγείο στη Μαζάρ-ε-Σαρίφ, το δυτικό αρχηγείο στη Χεράτ και το νότιο αρχηγείο στη Κανταχάρ.
ИСАФ спроведува патроли низ различни полициски области и е групирана под три команди: северниот штаб во Мазар-е-Шариф, западниот штаб во Херат и јужниот штаб во Кандахар.