Εν τω μεταξύ, σε ότι έχει να κάνει με σημαντικά ζητήματα όπως η καταδίωξη φερόμενων εγκληματιών πολέμου, η EUFOR θα έχει στενή συνεργασία με το ΝΑΤΟ, το οποίο θα διατηρήσει μειωμένη παρουσία στην Β-Ε μετά τη λήξη της θητείας της SFOR.
Во меfувреме, во врска со клучните прашаоа како што е фаќаоето на осомничените за воени злосторства, ЕУФОР тесно ќе соработува со НАТО, кој ќе задржи намалено присуство во БиХ по завршуваоето на мандатот на СФОР.