Ο Μλάντιτς εξαφανίστηκε μετά το τέλος του πολέμου 1992-1995 στη Βοσνία και Ερζεγοβίνη (Β-Ε), λίγους μήνες αφότου το διεθνές ποινικό δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία εξέδωσε το αρχικό του κατηγορητήριο με το οποίο τον κατηγορούσε για σωρεία εγκλημάτων πολέμου, περιλαμβανομένου και του μακελειού στη Σρεμπρένιτσα το 1995.
Младиќ исчезна по крајот на конфликтот во Босна и Херцеговина (БиХ) во периодот 1992-1995 година, само неколку месеци откако Меѓународниот кривичен трибунал за поранешна Југославија (МКТЈ) го издаде своето првично обвинение против него, товарајќи го за редица воени злосторства, меѓу кои и масакрот во Сребреница во 1995 година.