Ο Ζουπλιάνιν, σύμφωνα με τους εισαγγελείς του ΟΗΕ, συμμετείχε σε κοινή εγκληματική επιχείρηση, με στόχο "την εξάλειψη και μόνιμη απομάκρυνση, με βία ή άλλα μέσα, των Βοσνίων Μουσουλμάνων και των Βοσνίων Κροατών από την επικράτεια" της αυτο-ανακηρυσσόμενης Αυτόνομης Περιοχής της Κράινα.
Жупљанин, според наводите на обвинителите на ОН, учествувал во заеднички криминални дејства, чија цел била „елиминирање и перманентно отстранување, со сила или други средства, на босанските муслимани и босанските Хрвати од територијатија“ на самопрогласениот Автономен регион Краина.