Το ICTY διώκει ήδη τον πρώτο διοικητή του 3ου Σώματος ARBiH, Στρατηγό Ενβέρ Χαντζηχασάνοβιτς, και τον διοικητή της 7ης Μουσουλμανικής Ταξιαρχίας, Αμρί Κουμπούρα, για εγκλήματα που διεπράχθησαν από τους Ελ-Μουτζαχίντ.
МКТЈ веќе му суди на првиот командант на Третиот корпус на АРБиХ, генерал Енвер Хаџихасановиќ, како и на командантот на Седмата муслиманска бригада, Амир Кубура, за воени злосторства извршени од страна на Ел Муџахид.