Οι δυο χώρες διαφωνούν επίσης για τα χωρικά ύδατα στον Κόλπο Πιράν, καθώς επίσης αρκετά άλλα ζητήματα όπως τα μειονοτικά δικαιώματα και τα χρέη που οφείλονται σε Κροάτες πελάτες της Τράπεζας Λιουμπλιάνα.
Тие, исто така, имаат несогласувања за нивната поморска граница во Пиранскиот Залив, како и за голем број други прашања, како што се малцинските права и долговите на Љубљанска банка кон хрватските клиенти.