Σύμφωνα με κοινό κατηγορητήριο, ο Μρκσιτς ήταν διοικητής της 1ης Ταξιαρχίας Μηχανοκίνητων Φρουρών του JNA, η οποία φέρει τη βασική ευθύνη για την τριετή πολιορκία της Βούκοβαρ, η οποία οδήγησε στην παρεπόμενη πτώση το Νοέμβρη του 1991.
Според заедничкото обвинение, Мркшиќ бил командант на Првата стражарска моторизирана бригада на ЈНА, која ја сносела главната одговорност за тримесечната опсада на Вуковар, која доведе до негово конечно паѓање во ноември 1991 година.