Η σύγκρουση μεταξύ των δύο αυτών βασικών θεσμών κορυφώθηκε με την τρέχουσα υπόθεση εναντίον υπερεθνικιστικής, κοσμικής οργάνωσης γνωστή ως Εργκένεκον, τα μέλη της οποίας δικάζονται για φερόμενη απόπειρα ανατροπής της κυβέρνησης.
Конфликтот помеѓу овие главни институции достигна врв со тековниот случај против ултранационалистичката, секуларистичка група позната во јавноста како Ергенекон, на чии членови им се суди за наводен обид за соборување на власта.