ЦЕИ соработува со меѓународни организации и институции, како што се: Организацијата за економска соработка и развој, Советот на Европа, ОБСЕ, Европската банка за реконструкција и развој и Светската банка, и различни регионални структури, како што се: Јадранско-јонската иницијатива, Дунавскиот процес на соработка и Пактот на стабилност.
CEI sarađuje sa međunarodnim organizacijama i institucijama kao što su Organizacija za ekonomsku saradnju i razvoj, Savet Evrope, OEBS, Evropska banka za obnovu i razvoj i Svetska banka, i različite regionalne strukture, kao što su Jadransko-jonska inicijativa, Proces dunavske saradnje i Pakt za stabilnost.