За време на војната, Караџиќ беше претседател на републиката на Босанските Срби и на Националниот совет за безбедност, како и врховен командант на вооружените сили на Босанските Срби и лидер на Српската демократска партија.
Tokom rata, Karadžić je bio predsednik republike bosanskih Srba i njenog Saveta za nacionalnu bezbednost, kao i vrhovni komandant oružanih snaga bosanskih Srba i vođa Srpske demokratske stranke.