Поранешен сојузник на Милошевиќ, Милутиновиќ беше обвинет од страна на ICTY за неговата наводна улога во воени злосторства извршени за време на конфликтот од 1998-1999 година на Косово.
Milutinovića, inače bivšeg Miloševićevog saveznika, je Haški sud optužio zbog navodne uloge u ratnim zločinima počinjenim tokom sukoba na Kosovu 1998-1999.