Темата за муџахедините е многу деликатна во БиХ, со оглед на зголемените стравувања, по терористичките напади на Соединетите Американски Држави од 11-ти септември 2001-та година, дека некои од луѓето кои останаа во БиХ по војната би можеле да се инволвирани во терористички групи.
Mudžahedinsko pitanje u BiH veoma je osetljivo, imajući u vidu pojačan strah posle 11. septembra 2001. i napada na Sjedinjene Države, zbog toga što bi neki od mudžahedina koji su ostali u BiH posle rata mogli da imaju veze sa terorističkim grupama.