Друга сфера каде веќе се појавија проблеми за време на процесот на тестирање е усогласувањето на царинскиот режим на Хрватска со acquis communitaire.
Një tjetër fushë ku kanë dalë tashmë vështirësitë gjatë procesit të shqyrtimit është ajo e harmonizimit të regjimit doganor të Kroacisë me acquis communitaire.