Темата за муџахедините е многу деликатна во БиХ, со оглед на зголемените стравувања, по терористичките напади на Соединетите Американски Држави од 11-ти септември 2001-та година, дека некои од луѓето кои останаа во БиХ по војната би можеле да се инволвирани во терористички групи.
Çështja muxhahadine është mjaft delikate në BiH, duke ditur frikën e madhe pas sulmeve të 11 shtatorit 2001 në Shtetet e Bashkuara se disa prej njerëzve që qëndruan në BiH pas luftës mund të kenë lidhje me grupe terroristë.