Југоисточна Европа, исто така, е местото каде што се одвиваат активностите на Ал каеда на регрутирање, при што групата сака да ја искористи верската поделеност што ги разгоре балканските конфликти во 1990-тите.
Evropa Juglindore ka qenë gjithashtu një vend për veprimtaritë rekrutuese të al-Kaedës, me grupin që kërkonte të shfrytëzonte ndarjet fetare që ndezën konfliktet ballkanike të viteve 1990.