Караџиќ, заедно со неговиот воен командант Ратко Младиќ, е обвинет од страна на Меѓународниот кривичен трибунал за поранешна Југославија (МКТЈ).
Karaxhiç, së bashku me komandatin e tij ushtarak Ratko Mlladiç janë paditur nga Gjykata Penale Ndërkombëtare për ish Jugosllavinë (ICTY).