Во 1995 година МКТЈ издаде заедничко обвинение за воени злосторства против КараYиќ и неговиот главен воен командант, Ратко Младиќ, во кое тие се обвинуваат за нивните наводни улоги во злосторствата за време на војната во Босна и Херцеговина (БиХ) од 1992 до 1995 година.
Në 1995, ICTY lëshoi një padi të përbashkët kundër Karaxhiçit dhe komandantit të tij ushtarak, Ratko Mlladiç, duke i akuzuar ata për krime të luftës për rolin e tyre të dyshuar në mizori të ndryshme gjatë luftës në Bosnje e Herzegovinë (BiH), 1992-1995.