Завахири, чија ЕИЏ се вели дека се спои со Ал каеда во 1998 година, исто така се верува дека е еден од главните организатори на самоубиствениот бомбашки напад на УСС Кол покрај брегот на Јемен во 2000 година, и „мозокот“ на нападите во Соединетите Држави на 11-ти септември.
Zavahiri, EIJ e të cilit thuhet se është shkrirë me al-Kaedën më 1998, besohet gjithashtu të ketë qenë një nga organizatorët e bombës vetë-vrasëse në USS Cole pranë brigjeve të Jemenit më 2000 dhe "truri" pas sulmeve të 11 shtatorit në Shtetet e Bashkuara.