Neki smatraju da bi taj protokol mogao tužioce BiH staviti u inferiornu poziciju, tako da oni faktički postanu ogranak srbijanskog tužilaštva.
Unii simt că protocolul i-ar pune pe procurorii din BiH într-o poziţie inferioară, transformându-i -- în realitate -- într-o filială a procuraturii sârbe.