Grupa Ergenekon navodno je imala kontakte s drugim terorističkim grupama, poput marksističko-lenjinističke PKK i tursko-islamskog Hizbullaha.
Ergenekon se presupune că avea legături şi cu alte grupări teroriste, cum ar fi gruparea marxist-leninistă PKK şi gruparea turco-islamistă Hezbollah.