EULEX ima jedinstven lanac komande koji vodi do Brisela i radi u okviru Rezolucije 1244. Vijeća sigurnosti UN.
EULEX deţine un lanţ de conducere ierarhic unificat, este condusă de la Bruxelles şi îşi desfăşoară activitatea în cadrul Rezoluţiei 1244 a Consiliului de Securitate al ONU.