Mesićevi odnosi s hijerarhijom Katoličke crkve bili su pod stalnim tenzijama, jer je on kritizirao njihovo miješanje u politiku, a oni su kritizirali njega tvrdeći da on ne štiti nacionalne interese.
Relaţiile lui Mesic cu ierarhia Bisericii Catolice au fost permanent tensionate, acesta emiţând critici cu privire la implicarea bisericii în politică, iar aceasta criticându-l şi susţinând că nu apără interesele naţionale.