Slovačka je jedna od nekolicine članica EU -- među kojima su i Španija, Rumunija i Kipar -- koje su odbile da priznaju suverenost Kosova, u nekim slučajevima zbog zabrinutosti da bi se time uspostavio presedan za separatističke pokrete.
Slovacia se numără printre cei câţiva membri UE -- alături de Spania, România şi Cipru -- care au refuzat să recunoască suveranitatea Kosovo, în unele cazuri din cauza temerilor legate de crearea unor precedente pentru mişcările separatiste.