Pozivajući se na zločine počinjene od 1. jula 1991. do 30. novembra 1995, u izmijenjenoj optužnici tvrdi se da je Karadžić "planirao, poticao, naređivao, počinio i na drugi način potpomagao i navodio na planiranje, pripremu ili vršenje uništenja, u cjelini ili djelimično, nacionalnih, etnički, rasnih ili vjerskih grupa bosanskih Muslimana i bosanskih Hrvata", u nizu općina.
Referindu-se la atrocităţile comise în perioada 1 iulie 1991 – 30 noiembrie 1995, acuzaţia modificată pretinde că Karadzic ar fi „plănuit, instigat, ordonat, comis sau altminteri a ajutat şi instigat la plănuirea, pregătirea sau înfăptuirea distrugerilor, completă sau parţiale, asupra grupurilor naţionale, etnice, rasiale sau religioase de musulmani bosniaci şi croaţi bosniaci”, dintr-o serie de oraşe.