Milutinovic, along with four other former top Yugoslav officials, including Slobodan Milosevic, was indicted for atrocities allegedly committed during the 1998-1999 conflict in Kosovo.
Zajedno sa još četvoricom bivših visokih jugoslovenskih zvaničnika, uključujući i Slobodana Miloševića, Milutinović je optužen zbog zločina navodno počinjenih tokom rata na Kosovu 1998-1999.