От февруари до април 1992 г. Готовина е заместник-командир на специалното подразделение на Генералния щаб на Хърватската армия, а след това приема шестмесечно назначение в хърватския Съвет по отбрана.
Od veljače do travnja 1992. godine, Gotovina je bio zamjenik zapovjednika Posebne postrojbe Glavnog stožera Hrvatske vojske, nakon čega je šest mjeseci obnašao dužnosti u Hrvatskom vijeću obrane.