Караджич и неговият военновременен военачалник, Ратко Младич, изчезнаха няколко месеца, след като Международният наказателен съд за бивша Югославия (МНСБЮ) издаде през 1995 г. първоначалните си обвинителни актове срещу тях.
Kao i njegov vojni zapovjednik iz razdoblja rata Ratko Mladić, Karadžić je nestao nekoliko mjeseci nakon što je 1995. godine Međunarodni kazneni sud za bivšu Jugoslaviju (ICTY) podignuo prve optužnice protiv njih.