Отношенията му с йерархията на Католическата църква са постоянно напрегнати, тъй като той критикува намесата им в политиката, а те го критикуват, че не защитава националните интереси.
Mesićevi su odnosi s hijerarhijom katoličke crkve stalno su bili zategnuti, budući da je kritizirao njihovo uplitanje u politiku, a oni su njega kritizirali tvrdeći kako ne štiti nacionalne interese.