В това си качество той фактически и юридически командва и контролира всички хърватски сили, участващи в операция “Буря” в южната част на района на Краина, твърдят прокурорите на ООН в изменения обвинителен акт срещу Готовина, който бе публикуван през март 2004 г.
U tom svojstvu imao je de facto i de jure zapovjedništvo i nadzor nad svim hrvatskim snagama raspoređenim u sklopu Operacije Oluja u južnom dijelu regije Krajine, naveli su tužitelji u izmijenjenoj optužnici protiv Gotovine koja je objavljena u ožujku 2004. godine.