ЦЕИ си сътрудничи с международни организации и институции, като Организацията за икономическо сътрудничество и развитие, Съвета на Европа, ОССЕ, Европейската банка за възстановяване и развитие и Световната банка, както и с различни регионални структури, като Адриатическо-йонийската инициатива, Процесът на Дунавско сътрудничество и Пактът за стабилност.
CEI-a surađuje s međunarodnim organizacijama i institucijama kao što su Organizacija za gospodarsku suradnju i razvitak, Vijeće Europe, OESS, Europska banka za obnovu i razvitak i Svjetska banka, i različite regionalne strukture, kao što su Jadransko-jonska inicijativa, Proces dunavske suradnje i Pakt o stabilnosti.