Караджич, заедно с военния командир Ратко Младич, бяха обвинени от Международния наказателен съд за бивша Югославия (МНСБЮ).
Karadžić je, zajedno sa svojim vojnim zapovjednikom Ratkom Mladićem, optužen od strane Međunarodnog kaznenog tribunala za bivšu Jugoslaviju (ICTY).