В това си качество, той и де юре и де факто е командвал и контролирал всички хърватски сили на операция "Буря" в южната част на района на Крайна, твърдят прокурорите на ООН в коригираното обвинение срещу Готовина, публикувано през март 2004 г..
U tom svojstvu imao je de jure i de facto zapovjedništvo i nadzor nad svim hrvatskim snagama raspoređenim u sklopu operacije Oluja u južnom dijelu područja Krajine, ustvrdili su tužitelji UN u dopunjenoj optužnici protiv Gotovine, koja je objavljena u ožujku 2004. godine.