Турция е недоволна и от това, че е изключена от командването и контролните структури на операциите, водени от ЕС, които се провеждат в рамките на сътрудничеството между НАТО и ЕС, въпреки нейния значителен принос.
Turska je također frustrirana jer je izostavljena iz zapovjednih i nadzornih struktura u operacijama koje vodi EU, a koje se provode u okviru suradnje NATO-a i EU, unatoč tome što je u njima dala značajan doprinos.