Според общия обвинителен акт Мърксич е бил командир на 1-ва гвардейска моторизирана бригада на ЮНА, която носи главната отговорност за тримесечната обсада на Вуковар, довела до падането му през ноември 1991 г.
Prema zajedničkoj optužnici Mrkšić je bio zapovjednik 1. Gardijske motorizirane brigade JNA koja je snosila glavnu odgovornost za tromjesečnu opsadu Vukovara koja je dovela do konačnog pada grada u studenom 1991. godine.