Недостатъчна степен на независимост от законодателната и изпълнителната власти, неефективно водене на съдебните дела и дълго проточили се процеси, маса неразгледани случаи и необходимост от по-голям професионализъм сред съдии и прокурори - това са някои от предизвикателствата пред македонската съдебна система, която трябва да се хармонизира със стандартите на ЕС като част от усилията на страната за присъединяване към съюза.
Nezadovoljavajući stupanj neovisnosti od zakonodavnih i izvršnih vlasti, neučinkoviti sudski procesi i otegnuta suđenja, zaostali predmeti i potreba za većim profesionalizmom sudaca i tužitelja neki su od izazova s kojima se suočava makedonsko pravosuđe, koje je nužno uskladiti sa standardima EU u sklopu nastojanja zemlje na akcesiji.