По време на въздушните нападения на НАТО над Югославия Джуканович заяви, че Черна гора не участва в конфликта -- позиция, която донесе на републиката финансова подкрепа от ЕС и Съединените щати.
Tijekom zračne kampanje NATO-a protiv Jugoslavije, Đukanović je priopćio kako Crna Gora nije sudionik u sukobu -- što je bilo stajalište koje je Crnoj Gori donijelo financijsku potporu EU i Sjedinjenih Država.