Турската влиятелна и силно светски настроена армия, която е подозрителна към свързаната с ислямизма ПСР още от идването й на власт през 2003 г., отрича всякаква връзка с „Ергенекон” и сътрудничи на разследването.
Moćna i sasvim sekularna vojska Turske, koja je bila sumnjičava prema islamističkim temeljima AKP-a od njihovog dolaska na vlast 2003., porekla je svaku povezanost s Ergenekonom i surađuje u istrazi.