По време на двата президентски мандата на Глигоров, между 1991 и 1999 г., Македония стана член на ООН под временното наименование "Бивша югославска република Македония", прие временното споразумение с Гърция през 1995 г. и премина през противоречив икономически преход.
Tijekom dva mandata Gligorova na mjestu predsjednika, između 1991. i 1999. godine, Makedonija je postala članica Ujedinjenih naroda pod privremenim nazivom "Bivša Jugoslavenska Republika Makedonija", prihvaćenim Privremenim sporazumom s Grčkom 1995. godine te je pokrenula prijepornu gospodarsku tranziciju.