През 2003 г. прокурорите на ООН повдигнаха отделно обвинение срещу Станкович, което по-късно бе променено.
Nakon uhićenja od postrojbi SFOR-a 9. srpnja 2002., Stanković je sljedećeg dana prebačen u Haag . 2003, tužitelji UN-a podignuli su odvojenu optužnicu protiv Stankovića, koja je kasnije izmijenjena.