Обвинението на МНТЮ срещу него гласи, че Раич е командвал оперативна група на Хърватския съвет за отбрана (ХСО), въоръжените сили на самопровъзгласилата се Хърватска общност на Херцег-Босна, и че на 23 октомври 1993 година подразделения под негово командване са нападнали и сринали до основи Ступни Дол. 250-те жители на селото, разположено на около 4 км югоизточно от Вареш, са били почти изцяло мюсюлмани.
U optužnici ICTY-a navodi se da je Rajić zapovijedao operativnom skupinom Hrvatskog vijeća obrane (HVO), oružanih snaga samoproglašene Hrvatske zajednice Herceg-Bosne te da je 23. listopada 1993. godine postrojba pod njegovim zapovjedništvom napala i uništila selo Stupni Dol. U selu, koje se nalazi na oko 4 kilometara jugoistočno od Varesa, živjelo je 250 osoba od kojih su gotovo svi bili Muslimani.