Бреговата охрана функционира чрез две подразделения, гражданско звено под контрола на вътрешно министерство и военно звено, което е част от министерството на отбраната, които ще се слеят.
Obalna straža djeluje u dvama ograncima: civilni dio kojim upravlja ministarstvo unutarnjih poslova i vojni dio u okviru ministarstva obrane -- koji će biti spojeni.