Предявяват му се и две обвинения в геноцид заради 44-месечната обсада на Сараево и клането в Сребреница от 1995 г., което е най-голямата жестокост, извършена в Европа след Втората световна война.
Karadžić se tereti i za genocid zbog 44-mesečne opsade Sarajeva i masakra u Srebrenici 1995, najgoreg zločina u Evropi od Drugog svetskog rata.