Препоръките на КРО през 2003 г. доведоха до създаването на две вериги в командването – административна и оперативна под ръководството на Председателството и Министерството на отбраната като отговорен изпълнителен орган.
Preporuke KZO 2003. godine rezultirali su uspostavljanjem dva lanca komande - administrativnog i operativnog - na nivou Predsedništva, sa Ministarstvom odbrane na državnom nivou kao izvršnim telom.