Караджич и неговият военновременен военачалник, Ратко Младич, изчезнаха няколко месеца, след като Международният наказателен съд за бивша Югославия (МНСБЮ) издаде през 1995 г. първоначалните си обвинителни актове срещу тях.
Karadžić je, kao i njegov bivši vojni komandant, Ratko Mladić, nestao nekoliko meseci nakon što je Međunarodni krivični sud za bivšu Jugoslaviju (MKSJ) 1995. godine podigao prve optužnice protiv njih.