Този сектор се ръководи независимо в двете републики, които имат отделни министерства, закони и енергийни системи.
Srbija i Crna Gora potpisaće Ugovor o energiji svaka za sebe, pošto Državna zajednica nema ovlašćenja u oblasti energetike: tim sektorom samostalno upravljaju dve republike članice, koje imaju odvojena ministarstva, zakone i energetske sisteme.