Караджич, заедно с военния командир Ратко Младич, бяха обвинени от Международния наказателен съд за бивша Югославия (МНСБЮ).
Karadžić je, zajedno sa svojim vojnim komandantom Ratkom Mladićem, optužen od strane Međunarodnog krivičnog suda za bivšu Jugoslaviju (MKSJ).