ЦЕИ си сътрудничи с международни организации и институции, като Организацията за икономическо сътрудничество и развитие, Съвета на Европа, ОССЕ, Европейската банка за възстановяване и развитие и Световната банка, както и с различни регионални структури, като Адриатическо-йонийската инициатива, Процесът на Дунавско сътрудничество и Пактът за стабилност.
CEI sarađuje sa međunarodnim organizacijama i institucijama kao što su Organizacija za ekonomsku saradnju i razvoj, Savet Evrope, OEBS, Evropska banka za obnovu i razvoj i Svetska banka, i različite regionalne strukture, kao što su Jadransko-jonska inicijativa, Proces dunavske saradnje i Pakt za stabilnost.