Ο Μιλόσεβιτς αρνήθηκε συμμετοχή στη σφαγή της Σρεμπρένιτσα το 1995, ενώ ένας προστατευόμενος μάρτυρας, ο οποίος έλαβε μέρος στις δολοφονίες κατέθεσε ότι μια τέτοια μαζική και καλά οργανωμένη επιχείρηση δεν θα είχε πραγματοποιηθεί χωρίς την έγκριση υψηλόβαθμων διοικητών.
Milošević je zanijekao umiješanost u pokolj u Srebrenici 1995. godine, dok je zaštićeni svjedok koji je sudjelovao u ubojstvima izjavio kako se tako opsežna, dobro organizirana operacija ne bi mogla izvesti bez odobrenja najviših zapovjednika.