Ένα από τα πλέον ακανθώδη θέματα στην ατζέντα της Λισαβόνας είναι το σχέδιο ανάπτυξης συστήματος πυραυλικής προστασίας για την προστασία όλων των χωρών της Συμμαχίας από πιθανές απειλές.
Jedno od najproblematičnijih pitanja na dnevnom redu u Lisabonu bit će plan za razvoj proturaketne obrane koja bi štitila sve članice Saveza od potencijalnih prijetnji.