Όμως τα δομικά προβλήματα παραμένουν, μεταξύ των οποίων, πολυάριθμο προσωπικό, πολλά επίπεδα αρχών, έλλειψη κεφαλαίων και ελάχιστη ή καμία συνεργασία μεταξύ της αστυνομίας σε διαφορετικές περιοχές της χώρας, ειδικά μεταξύ των δυο οντοτήτων -- τη Δημοκρατία Σρπσκα (RS) και την Μουσουλμανική-Κροατική Ομοσπονδία -- οι οποίες αποτελούν τη μεταπολεμική Β-Ε.
Međutim strukturni problemi ostaju, uključujući prevelik broj pripadnika policije, previše razina vlasti, nedostatak sredstava i slabu ili nikakvu suradnju između policija u različitim područjima zemlje, posebice između dvaju entiteta -- Republike Srpske (RS) i Muslimansko Hrvatske Federacije -- koji čine poslijeratnu BiH.