Σύμφωνα με τους εισαγγελείς, "παρέβλεπε και ενθάρρυνε" εγκληματικές πράξεις των υφισταμένων του και "σε μερικές περιπτώσεις, διέταζε, ήλεγχε και συμμετείχε προσωπικά σε ξυλοδαρμούς." Επίσης ισχυρίζονται ότι "σε τουλάχιστον μια περίπτωση, έδωσε σιωπηρή έγκριση ως διοικητής για εκτέλεση κρατουμένων".
Prema riječima tužitelja, Haradinaj je "praštao i ohrabrivao" kriminalne postupke svojih podređenih i "u nekim slučajevima osobno naređivao, nadzirao i sudjelovao u premlaćivanjima". Tužitelji također tvrde kako je "u najmanje jednom slučaju, kao zapovjednik prešutno odobrio pogubljenja zatočenika".