Κατά τη διάρκεια των αεροπορικών επιδρομών του ΝΑΤΟ εναντίον της Γιουγκοσλαβίας, ο Ντζουκάνοβιτς ανέφερε ότι το Μαυροβούνιο δεν συμμετείχε στη σύγκρουση -- στάση η οποία είχε ως αποτέλεσμα την οικονομική στήριξη της δημοκρατίας από ΕΕ και Ηνωμένες Πολιτείες.
Tijekom zračne kampanje NATO-a protiv Jugoslavije, Đukanović je priopćio kako Crna Gora nije sudionik u sukobu -- što je bilo stajalište koje je Crnoj Gori donijelo financijsku potporu EU i Sjedinjenih Država.