Ο Μπάμπιτς κατηγορήθηκε από το Διεθνές Ποινικό Δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία (ICTY) το Νοέμβριο του 2003, κατηγορούμενος για εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας, για πολιτικές, φυλετικές και θρησκευτικές διώξεις και τέσσερις κατηγορίες για παραβιάσεις νόμων ή θεσμών του πολέμου, συμπεριλαμβανομένης της δολοφονίας, βάναυσης μεταχείρισης, απρόκλητη ή στρατιωτικά περιττής καταστροφής χωριών και καταστροφή ή πρόκληση ζημιών σε εκπαιδευτικά και θρησκευτικά ιδρύματα.
Međunarodni kazneni tribunal za bivšu Jugoslaviju (ICTY) podignuo je u studenom 2003. godine optužnicu protiv Babića za zločine protiv čovječnosti zbog progona na političkoj, rasnoj i vjerskoj osnovi, kao i još četiri točke koje ga terete za kršenje pravila i običaja rata, uključujući ubojstva, zlostavljanja, hotimično ili vojno neopravdano razaranje sela i uništavanje ili ostećivanje obrazovnih ili vjerskih institucija.