Η ISAF πραγματοποιεί περιπολίες σε διάφορες αστυνομικές περιφέρειες και τελεί υπό τις εντολές τριών διοικήσεων: το βόρειο αρχηγείο στη Μαζάρ-ε-Σαρίφ, το δυτικό αρχηγείο στη Χεράτ και το νότιο αρχηγείο στη Κανταχάρ.
ISAF vrši ophodnje diljem različitih policijskih okruga i grupiran je u trima zapovjedništvima: sjeverni stožer u Mazar-e-Sharifu, zapadni stožer u Heratu i južni stožer u Kandaharu.