Ministerele apărării din cele două entităţi vor păstra doar o structură ierarhică administrativă pentru recrutare şi scopuri logistice, fiind înfiinţată o structură ierarhică operaţională prin statul major comun şi comandamentul operaţional subordonat.
Entitetska ministarstva odbrane zadržaće samo administrativni lanac komande za regrutaciju i u logističke svrhe, dok će operativni lanac komandovanja biti uspostavljan kroz združeni generalštab i podređenu operativnu komandu.