Gotovina a fost acuzat de crime împotriva umanităţii, responsabilitate ierarhică pentru faptul că nu a prevenit uciderea civililor, precum şi pentru utilizarea în exces a armelor împotriva ţintelor civile.
Gotovina je optužen za zločine protiv čovečnosti, komandnu odgovornost zbog propusta da se spreče ubistva civila i prekomerno korišćenje oružja protiv civilnih meta.