Potrivit inculpării comune, Mrksic a fost comandantul Brigăzii a I-a Motorizate de Gardă a JNA, care poartă responsabilitatea principală pentru asediul de trei luni al oraşului Vukovar, asediu ce s-a soldat în cele din urmă cu căderea oraşului în noiembrie 1991.
Prema zajedničkoj optužnici, Mrkšić je bio komandant 1. Gardijske motorizovane brigade JNA koja je snosila glavnu odgovornost za tromesečnu opsadu Vukovara koja je dovela do konačnog pada u novembru 1991. godine.