Împotriva acestuia au fost înaintate de asemenea două acuzaţii de genocid în legătură cu asediul de 43 de luni al oraşului Saraievo şi masacrarea a 8 000 de bărbaţi şi băieţi musulmani bosniaci în 1995, la Srebrenica.
Protiv Karadžića je takođe podneta optužnica po dve tačke za genocid u vezi sa 43-mesečnom opsadom Sarajeva i masakra u Srebrenici 1995. u kome je ubijeno osam hiljada muslimanskih muškaraca i dečaka.