Câţiva asociaţi ai lui Djindjic, precum Vladimir Popovic, au acuzat forţe puternice din ţară, inclusiv facţiuni din Armata sârbă, Biserica Ortodoxă, Academia de Ştiinţe şi Arte, precum şi pe Kostunica şi aliaţii săi politici, că s-ar afla în spatele crimei.
Neki Đinđićevi saradnici, poput Vladimira Popovića, optužili su moćne krugove u zemlji, uključujući delove Vojske Srbije i Crne Gore, Pravoslavnu crkvu, Akademiju nauka i umetnosti, kao i Koštunicu i njegove političke saveznike da stoje iza ubistva premijera.