Raziile au provocat iniţial fricţiuni cu guvernul kosovar, care a declarat că el este cel mandatat să lupte împotriva corupţiei şi că EULEX ar trebui să se rezume la atribuţiile sale de îndrumare şi consiliere.
Akcije EULEKS-a su u prvom trenutku izazvale napetost sa kosovskom vladom, koja je saopštila da je ona ta koja je ovlašćena za borbu protiv korupcije i da bi EULEKS trebalo da se drži svog savetodavnog mandata.