Se presupune că motivul crimei a fost faptul că Djindjic dorea să trimită la Haga câţiva dintre membrii unităţii de elită Beretele Roşii, după care intenţiona să desfiinţeze unitatea.
Motiv za ubistvo navodno je bio to što je Đinđić nameravao da pošalje više pripadnika Crvenih beretki u Hag -- posle čega je planirao da tu jedinicu raspusti.