Karadzic şi comandantul său militar Ratko Mladic au fost inculpaţi de Tribunalul Penal Internaţional pentru Fosta Iugoslavie (TPII).
Karadžić je, zajedno sa svojim vojnim komandantom Ratkom Mladićem, optužen od strane Međunarodnog krivičnog suda za bivšu Jugoslaviju (MKSJ).