Ultimul din foştii aliaţi ai lui Slobodan Milosevic care şi-a păstrat funcţia supremă după înlăturarea fostului lider iugoslav în octombrie 2000, Milutinovic se află în prezent în detenţie la tribunalul ONU pentru crime de război de la Haga, aşteptând să fie judecat pentru presupusa sa implicare în atrocităţile comise în cursul conflictului din 1998-1999 din Kosovo.
Jedini saradnik Slobodana Miloševića koji je ostao na visokoj funkciji posle zbacivanja sa vlasti bivšeg jugoslovenskog lidera u oktobru 2000. godine, Milutinović se trenutno nalazi u pritvoru Haškog suda za ratne zločine, gde čeka početak suđenja zbog navodne umešanosti u zločine počinjene tokom sukoba na Kosovu 1998-1999.