Într-o anchetă separată numită Ergenekon, care a început în 2007, o serie de alţi ofiţeri de rang înalt au fost arestaţi pentru acuzaţii similare.
U odvojenoj istrazi pod nazivom Ergenekon, koja je počela 2007, izvestan broj drugih visokih oficira uhapšen je na osnovu sličnih optužbi.