Rupel a exprimat de asemenea sprijinul ţării sale pentru aderarea la UE a Croaţiei, afirmând că "Slovenia doreşte ca Croaţia să devină membră a Uniunii Europene şi să înlăture toate obstacolele şi dificultăţile cât mai curând posibil".
Rupel je takođe izrazio podršku svoje zemlje pridruživanju Hrvatske EU, ukazujući da "Slovenija želi da Hrvatska postane član Evropske unije i ukloni sve prepreke i poteškoće što je pre moguće".