Procurorii l-au acuzat pe Beqaj că, în perioada iunie -octombrie 2004, a influenţat în şase ocazii un martor şi un potenţial martor, denumiţi B1 şi respectiv B2, în cazul intentat foştilor membri ai Armatei de Eliberare a Kosovo (KLA) Fatmir Limaj, Haradin Bala şi Isak Musliu.
Tužioci su tvrdili da je Bećaj u šest prilika u periodu između juna i oktobra 2004. godine vršio uticaj na jednog svedoka i potencijalnog svedoka, pod oznakom B1 i B2, u vezi sa predmetom protiv bivših pripadnika Oslobodilačke vojske Kosova (OVK), Fatmira Limaja, Haradina Bale i Isaka Muslijua.