TPII a adus împotriva lui Krajisnik două capete de acuzare pentru genocid, cinci capete de acuzare pentru crime împotriva umanităţii şi un cap de acuzare pentru încălcarea legilor sau principiilor războiului.
MKSJ po dve tačke optužnice tereti Krajišnika za genocid, po pet tačaka za zločine protiv čovečnosti i po jednoj tački za kršenje pravila i običaja ratovanja.