تحتل المسألة القومية مكانة مركزية في خطاب هابرماس حول الإرهاب؛ فهو يزعم أن إرهابيي اليوم، الذين يخوضون حربا مقدسة، كانوا في الأمس قوميين علمانيين؛ إذ يبدو أن خيبة الأمل من الأنظمة القومية الحاكمة  كأنظمة إيران والعراق والسعودية، بل حتى النظام في باكستان  جعلت الدين يغدو أكثر إقناعا من أي دافع سياسي علماني من الناحية الذاتية