Todos los individuos tienen una racionalidad implantada "por el mismo Dios" (I, 86) por la cual pueden discernir entre el bien y el mal, y cuyo primer y más fuerte deseo "es el de la auto-preservación" (I, 88) y el de preservar la humanidad de dañar al otro (II, 6), pues la vida, la libertad y los bienes son propiedad de toda persona (II, 87), en tanto son sus derechos irrenunciables.El Segundo tratado es un texto clásico sobre la ley natural. Sin embargo, existe una cierta contradicción con el Ensayo sobre el entendimiento humano (ambas obras publicadas, como dijimos, el mismo año): si en la primera obra afirma que es posible tener un conocimiento deductivo de las leyes naturales a través de la razón, en la segunda socava la posibilidad de la existencia de tales leyes ya que no podemos tener conocimiento innato de las mismas, y además la experiencia demostró que en diferentes épocas y sociedades la humanidad divergía acerca de los verdaderos contenidos de ellas. Si ninguna idea es innata y no hay prueba empírica de la ley natural, la existencia de ésta es insostenible. 