什麼是結構基因組學？
結構基因組學試圖描述給定基因組編碼的每種蛋白質的三維結構。這種基於基因組的方法允許透過實驗和建模方法相結合的高通量結構測定方法。結構基因組學和傳統結構預測之間的主要區別在於，結構基因組學試圖確定基因組編碼的每種蛋白質的結構，而不是專注於一種特定的蛋白質。藉助可用的全基因組序列，可以透過實驗和建模方法的結合更快地完成結構預測，特別是因為大量測序基因組和先前解決的蛋白質結構的可用性使科學家能夠根據先前解決的結構對蛋白質結構進行建模同系物。

由於蛋白質結構與蛋白質功能密切相關，因此結構基因組學有可能提供有關蛋白質功能的知識。除了闡明蛋白質功能之外，結構基因組學還可用於識別新的蛋白質折疊和藥物發現的潛在靶標。結構基因組學涉及採用大量方法來確定結構，包括使用基因組序列的實驗方法或基於與已知結構的蛋白質的序列或結構同源性的基於建模的方法，或基於與已知結構的蛋白質無同源性的蛋白質的化學和物理原理。任何已知的結構。

與傳統的結構生物學相反，透過結構基因組學努力確定蛋白質結構通常（但並非總是）先於對蛋白質功能的瞭解。這給結構生物資訊學提出了新的挑戰，即從 3D 結構確定蛋白質功能。

結構基因組學強調蛋白質結構的高通量測定。這是在專門的結構基因組學中心進行的。

大多數結構生物學家都在研究單個蛋白質或蛋白質組的結構，而結構基因組學專家則在基因組範圍內研究蛋白質的結構。這意味著大規模克隆、表達和純化。這種方法的一個主要優點是規模經濟。另一方面，一些由此產生的結構的科學價值有時受到質疑。 2006 年 1 月的一篇 Science 文章分析了結構基因組學領域。

結構基因組學（例如蛋白質結構計劃）的優勢之一是科學界可以立即獲得新的結構以及克隆和蛋白質等試劑。缺點是許多這些結構是功能未知的蛋白質並且沒有相應的出版物。這需要新的方式將這種結構資訊傳達給更廣泛的研究界。結構基因組學聯閤中心 (JCSG) 的生物資訊學核心最近開發了一種基於 wiki 的方法，即開放蛋白質結構註釋網路 (TOPSAN)，用於註釋高通量結構基因組學中心出現的蛋白質結構。