कुबलाई खान द्वारा बनाई गई नौकरशाही की प्रणाली ने साम्राज्य में विभिन्न संस्कृतियों जैसे हान चीनी, खितान, जर्केंस, मंगोल और तिब्बती बौद्ध को प्रतिबिंबित किया। हालांकि संस्थानों की आधिकारिक शब्दावली यह संकेत दे सकती है कि सरकारी संरचना लगभग पूरी तरह से देशी चीनी राजवंशों की थी, युआन नौकरशाही वास्तव में विभिन्न संस्कृतियों के तत्वों के मिश्रण से बनी थी। नौकरशाही के चीनी शैली के तत्व मुख्य रूप से देशी तांग, सांग, साथ ही साथ खेतान लियाओ और जर्केन जिन राजवंशों से आए थे। चीनी सलाहकारों जैसे कि लियू बिंगज़ॉन्ग और याओ शू ने कुबलाई के शुरुआती दरबार को मजबूत प्रभाव दिया, और कुबलाई के शासन के पहले दशक के भीतर केंद्र सरकार के प्रशासन को स्थापित किया गया था। इस सरकार ने पारंपरिक चीनी त्रिपक्षीय अधिकार का विभाजन नागरिक, सैन्य, और आलोचनात्मक कार्यालय के बीच अपनाया, जिसमें नागरिक मामलों का प्रबंधन करने के लिए केंद्रीय सचिवालय (झोंगशू शेंग), प्रिविंस काउंसिल (चीनी:樞密院) सैन्य मामलों का प्रबंधन और आंतरिक निगरानी और निरीक्षण करने के लिए सेंसर किया। हालांकि, दोनों केंद्रीय और स्थानीय सरकारी संस्थानों के वास्तविक कार्यों ने नागरिक और सैन्य न्यायालयों के बीच एक प्रमुख अधिव्यापन दिखाया, जोकि शासन के मूल के रूप में सैन्य संस्थानों और कार्यालयों पर मंगोल की पारंपरिक निर्भरता के कारण था। फिर भी, ऐसी नागरिक नौकरशाही, केंद्रीय सचिवालय के साथ शीर्ष संस्था के रूप में थी जो (प्रत्यक्ष या अप्रत्यक्ष रूप से) अधिकांश अन्य सरकारी एजेंसियों (जैसेकि पारंपरिक चीनी शैली के छह मंत्रालयों) के लिए जिम्मेदार थी, जो चीन में बनाई गई थी। कई बार एक अन्य केंद्रीय सरकारी संस्थान ने राज्य मामलों के विभाग (शांगशू शेंग) को कहा था कि मुख्य रूप से वित्त से निपटने के लिए स्थापित गया था (जैसे कि कुल्लुग खान या सम्राट वुज़ोंग के शासनकाल के दौरान), लेकिन इसे कुछ समय के तुरंत बाद बंद कर दिया गया था।
त्रिपक्षीय
कुबलाई खान द्वारा बनाई गई नौकरशाही की प्रणाली ने साम्राज्य में विभिन्न संस्कृतियों जैसे हान चीनी, खितान, जर्केंस, मंगोल और तिब्बती बौद्ध को प्रतिबिंबित किया। हालांकि संस्थानों की आधिकारिक शब्दावली यह संकेत दे सकती है कि सरकारी संरचना लगभग पूरी तरह से देशी चीनी राजवंशों की थी, युआन नौकरशाही वास्तव में विभिन्न संस्कृतियों के तत्वों के मिश्रण से बनी थी। नौकरशाही के चीनी शैली के तत्व मुख्य रूप से देशी तांग, सांग, साथ ही साथ खेतान लियाओ और जर्केन जिन राजवंशों से आए थे। चीनी सलाहकारों जैसे कि लियू बिंगज़ॉन्ग और याओ शू ने कुबलाई के शुरुआती दरबार को मजबूत प्रभाव दिया, और कुबलाई के शासन के पहले दशक के भीतर केंद्र सरकार के प्रशासन को स्थापित किया गया था। इस सरकार ने पारंपरिक चीनी त्रिपक्षीय अधिकार का विभाजन नागरिक, सैन्य, और आलोचनात्मक कार्यालय के बीच अपनाया, जिसमें नागरिक मामलों का प्रबंधन करने के लिए केंद्रीय सचिवालय (झोंगशू शेंग), प्रिविंस काउंसिल (चीनी:樞密院) सैन्य मामलों का प्रबंधन और आंतरिक निगरानी और निरीक्षण करने के लिए सेंसर किया। हालांकि, दोनों केंद्रीय और स्थानीय सरकारी संस्थानों के वास्तविक कार्यों ने नागरिक और सैन्य न्यायालयों के बीच एक प्रमुख अधिव्यापन दिखाया, जोकि शासन के मूल के रूप में सैन्य संस्थानों और कार्यालयों पर मंगोल की पारंपरिक निर्भरता के कारण था। फिर भी, ऐसी नागरिक नौकरशाही, केंद्रीय सचिवालय के साथ शीर्ष संस्था के रूप में थी जो (प्रत्यक्ष या अप्रत्यक्ष रूप से) अधिकांश अन्य सरकारी एजेंसियों (जैसेकि पारंपरिक चीनी शैली के छह मंत्रालयों) के लिए जिम्मेदार थी, जो चीन में बनाई गई थी। कई बार एक अन्य केंद्रीय सरकारी संस्थान ने राज्य मामलों के विभाग (शांगशू शेंग) को कहा था कि मुख्य रूप से वित्त से निपटने के लिए स्थापित गया था (जैसे कि कुल्लुग खान या सम्राट वुज़ोंग के शासनकाल के दौरान), लेकिन इसे कुछ समय के तुरंत बाद बंद कर दिया गया था।