इन घटनाओं के कारण तेजी से मैरी की हार हुई और उसे लोच लेवेन कैसल में कैद कर लिया गया। स्कॉटिश लॉर्ड्स ने उन्हें अपने बेटे जेम्स VI के पक्ष में पद छोड़ने के लिए मजबूर किया, जिसका जन्म जून 1566 में हुआ था। जेम्स को प्रोटेस्टेंट के रूप में पालने के लिए स्टर्लिंग कैसल ले जाया गया था। मैरी 1568 में लोच लेवेन से भाग निकलीं लेकिन एक और हार के बाद सीमा पार इंग्लैंड भाग गईं, जहां उन्हें एक बार एलिजाबेथ से समर्थन का आश्वासन दिया गया था। एलिज़ाबेथ की पहली प्रवृत्ति अपने साथी सम्राट को बहाल करने की थी; लेकिन उसने और उसकी परिषद ने इसके बजाय सुरक्षित खेलना चुना। मैरी को अंग्रेजी सेना के साथ स्कॉटलैंड लौटाने या उसे फ्रांस और इंग्लैंड के कैथोलिक दुश्मनों के पास भेजने का जोखिम उठाने के बजाय, उन्होंने उसे इंग्लैंड में हिरासत में ले लिया, जहां उसे अगले उन्नीस वर्षों के लिए कैद में रखा गया।
एलिज़ाबेथ
इन घटनाओं के कारण तेजी से मैरी की हार हुई और उसे लोच लेवेन कैसल में कैद कर लिया गया। स्कॉटिश लॉर्ड्स ने उन्हें अपने बेटे जेम्स VI के पक्ष में पद छोड़ने के लिए मजबूर किया, जिसका जन्म जून 1566 में हुआ था। जेम्स को प्रोटेस्टेंट के रूप में पालने के लिए स्टर्लिंग कैसल ले जाया गया था। मैरी 1568 में लोच लेवेन से भाग निकलीं लेकिन एक और हार के बाद सीमा पार इंग्लैंड भाग गईं, जहां उन्हें एक बार एलिजाबेथ से समर्थन का आश्वासन दिया गया था। एलिज़ाबेथ की पहली प्रवृत्ति अपने साथी सम्राट को बहाल करने की थी; लेकिन उसने और उसकी परिषद ने इसके बजाय सुरक्षित खेलना चुना। मैरी को अंग्रेजी सेना के साथ स्कॉटलैंड लौटाने या उसे फ्रांस और इंग्लैंड के कैथोलिक दुश्मनों के पास भेजने का जोखिम उठाने के बजाय, उन्होंने उसे इंग्लैंड में हिरासत में ले लिया, जहां उसे अगले उन्नीस वर्षों के लिए कैद में रखा गया।