बड़ी मात्रा में एंटीबॉडी के लिए किसी स्तनपायी, जैसे चूहे, चूहे, खरगोश, बकरी, भेड़ या घोड़े में एंटीजन इंजेक्ट करके विशिष्ट एंटीबॉडी का उत्पादन किया जाता है। इन जानवरों से अलग किए गए रक्त में सीरम में पॉलीक्लोनल एंटीबॉडी - कई एंटीबॉडी होते हैं जो एक ही एंटीजन से जुड़ते हैं - जिन्हें अब एंटीसीरम कहा जा सकता है। अंडे की जर्दी में पॉलीक्लोनल एंटीबॉडी उत्पन्न करने के लिए मुर्गियों में एंटीजन भी इंजेक्ट किए जाते हैं। किसी एंटीजन के एकल एपिटोप के लिए विशिष्ट एंटीबॉडी प्राप्त करने के लिए, एंटीबॉडी-स्रावित लिम्फोसाइटों को जानवर से अलग किया जाता है और उन्हें कैंसर कोशिका रेखा के साथ जोड़कर अमर कर दिया जाता है। जुड़ी हुई कोशिकाओं को हाइब्रिडोमास कहा जाता है, और वे लगातार विकसित होंगी और संस्कृति में एंटीबॉडी का स्राव करेंगी। सेल क्लोन उत्पन्न करने के लिए एकल हाइब्रिडोमा कोशिकाओं को तनुकरण क्लोनिंग द्वारा अलग किया जाता है जो सभी समान एंटीबॉडी का उत्पादन करते हैं; इन एंटीबॉडीज़ को मोनोक्लोनल एंटीबॉडीज़ कहा जाता है। पॉलीक्लोनल और मोनोक्लोनल एंटीबॉडी को अक्सर प्रोटीन ए/जी या एंटीजन-एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का उपयोग करके शुद्ध किया जाता है। शोध में, शुद्ध एंटीबॉडी का उपयोग कई अनुप्रयोगों में किया जाता है। अनुसंधान अनुप्रयोगों के लिए एंटीबॉडी सीधे एंटीबॉडी आपूर्तिकर्ताओं से, या किसी विशेषज्ञ खोज इंजन के उपयोग के माध्यम से पाई जा सकती हैं। अनुसंधान एंटीबॉडी का उपयोग आमतौर पर इंट्रासेल्युलर और बाह्य कोशिकीय प्रोटीन की पहचान और पता लगाने के लिए किया जाता है। एंटीबॉडी का उपयोग फ्लो साइटोमेट्री में उनके द्वारा व्यक्त प्रोटीन द्वारा कोशिका प्रकारों को अलग करने के लिए किया जाता है; विभिन्न प्रकार की कोशिकाएँ अपनी सतह पर विभेदन अणुओं के समूह के विभिन्न संयोजनों को व्यक्त करती हैं, और विभिन्न अंतःकोशिकीय और स्रावित प्रोटीन का उत्पादन करती हैं। इनका उपयोग सेल लाइसेट में अन्य अणुओं से प्रोटीन और उनसे बंधी किसी भी चीज (सह-इम्यूनोप्रेसिपिटेशन) को अलग करने के लिए इम्यूनोप्रेसेपिटेशन में भी किया जाता है, वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषण में इलेक्ट्रोफोरेसिस द्वारा अलग किए गए प्रोटीन की पहचान करने के लिए और इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री या इम्यूनोफ्लोरेसेंस में ऊतक वर्गों में प्रोटीन की अभिव्यक्ति की जांच करने के लिए किया जाता है। या माइक्रोस्कोप की सहायता से कोशिकाओं के भीतर प्रोटीन का पता लगाना। एलिसा और एलिसपोट तकनीकों का उपयोग करके एंटीबॉडी के साथ प्रोटीन का भी पता लगाया जा सकता है और मात्रा निर्धारित की जा सकती है। अनुसंधान में उपयोग की जाने वाली एंटीबॉडी सबसे शक्तिशाली, फिर भी सबसे अधिक समस्याग्रस्त अभिकर्मकों में से एक हैं, जिनमें जबरदस्त संख्या में कारक होते हैं जिन्हें क्रॉस रिएक्टिविटी सहित किसी भी प्रयोग में नियंत्रित किया जाना चाहिए। एंटीबॉडी कई एपिटोप्स और आत्मीयता को पहचानती है, जो पीएच, विलायक, ऊतक की स्थिति इत्यादि जैसे प्रयोगात्मक स्थितियों के आधार पर व्यापक रूप से भिन्न हो सकती है। शोधकर्ताओं ने एंटीबॉडी को मान्य करने के तरीके और एंटीबॉडी पर रिपोर्ट करने के तरीके दोनों में सुधार करने के लिए कई प्रयास किए हैं। अपने काम में एंटीबॉडी का उपयोग करने वाले शोधकर्ताओं को अपने शोध को पुनरुत्पादित करने (और इसलिए अन्य शोधकर्ताओं द्वारा परीक्षण और योग्य) की अनुमति देने के लिए उन्हें सही ढंग से रिकॉर्ड करने की आवश्यकता है। अकादमिक पेपरों में संदर्भित आधे से भी कम शोध एंटीबॉडी को आसानी से पहचाना जा सकता है। 2014 और 2015 में एफ1000 में प्रकाशित पेपर शोधकर्ताओं को अनुसंधान एंटीबॉडी उपयोग की रिपोर्टिंग के लिए एक गाइड प्रदान करते हैं। आरआरआईडी पेपर, 4 पत्रिकाओं में सह-प्रकाशित है, जिन्होंने अनुसंधान संसाधन उद्धरण के लिए आरआरआईडी मानक लागू किया है, जो एंटीबॉडी पहचानकर्ताओं के स्रोत के रूप में एंटीबॉडीरजिस्ट्री.ओआरजी से डेटा खींचता है (फोर्स 11 पर समूह भी देखें)
प्रोटीन ए/जी या एंटीजन-एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी
बड़ी मात्रा में एंटीबॉडी के लिए किसी स्तनपायी, जैसे चूहे, चूहे, खरगोश, बकरी, भेड़ या घोड़े में एंटीजन इंजेक्ट करके विशिष्ट एंटीबॉडी का उत्पादन किया जाता है। इन जानवरों से अलग किए गए रक्त में सीरम में पॉलीक्लोनल एंटीबॉडी - कई एंटीबॉडी होते हैं जो एक ही एंटीजन से जुड़ते हैं - जिन्हें अब एंटीसीरम कहा जा सकता है। अंडे की जर्दी में पॉलीक्लोनल एंटीबॉडी उत्पन्न करने के लिए मुर्गियों में एंटीजन भी इंजेक्ट किए जाते हैं। किसी एंटीजन के एकल एपिटोप के लिए विशिष्ट एंटीबॉडी प्राप्त करने के लिए, एंटीबॉडी-स्रावित लिम्फोसाइटों को जानवर से अलग किया जाता है और उन्हें कैंसर कोशिका रेखा के साथ जोड़कर अमर कर दिया जाता है। जुड़ी हुई कोशिकाओं को हाइब्रिडोमास कहा जाता है, और वे लगातार विकसित होंगी और संस्कृति में एंटीबॉडी का स्राव करेंगी। सेल क्लोन उत्पन्न करने के लिए एकल हाइब्रिडोमा कोशिकाओं को तनुकरण क्लोनिंग द्वारा अलग किया जाता है जो सभी समान एंटीबॉडी का उत्पादन करते हैं; इन एंटीबॉडीज़ को मोनोक्लोनल एंटीबॉडीज़ कहा जाता है। पॉलीक्लोनल और मोनोक्लोनल एंटीबॉडी को अक्सर प्रोटीन ए/जी या एंटीजन-एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का उपयोग करके शुद्ध किया जाता है। शोध में, शुद्ध एंटीबॉडी का उपयोग कई अनुप्रयोगों में किया जाता है। अनुसंधान अनुप्रयोगों के लिए एंटीबॉडी सीधे एंटीबॉडी आपूर्तिकर्ताओं से, या किसी विशेषज्ञ खोज इंजन के उपयोग के माध्यम से पाई जा सकती हैं। अनुसंधान एंटीबॉडी का उपयोग आमतौर पर इंट्रासेल्युलर और बाह्य कोशिकीय प्रोटीन की पहचान और पता लगाने के लिए किया जाता है। एंटीबॉडी का उपयोग फ्लो साइटोमेट्री में उनके द्वारा व्यक्त प्रोटीन द्वारा कोशिका प्रकारों को अलग करने के लिए किया जाता है; विभिन्न प्रकार की कोशिकाएँ अपनी सतह पर विभेदन अणुओं के समूह के विभिन्न संयोजनों को व्यक्त करती हैं, और विभिन्न अंतःकोशिकीय और स्रावित प्रोटीन का उत्पादन करती हैं। इनका उपयोग सेल लाइसेट में अन्य अणुओं से प्रोटीन और उनसे बंधी किसी भी चीज (सह-इम्यूनोप्रेसिपिटेशन) को अलग करने के लिए इम्यूनोप्रेसेपिटेशन में भी किया जाता है, वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषण में इलेक्ट्रोफोरेसिस द्वारा अलग किए गए प्रोटीन की पहचान करने के लिए और इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री या इम्यूनोफ्लोरेसेंस में ऊतक वर्गों में प्रोटीन की अभिव्यक्ति की जांच करने के लिए किया जाता है। या माइक्रोस्कोप की सहायता से कोशिकाओं के भीतर प्रोटीन का पता लगाना। एलिसा और एलिसपोट तकनीकों का उपयोग करके एंटीबॉडी के साथ प्रोटीन का भी पता लगाया जा सकता है और मात्रा निर्धारित की जा सकती है। अनुसंधान में उपयोग की जाने वाली एंटीबॉडी सबसे शक्तिशाली, फिर भी सबसे अधिक समस्याग्रस्त अभिकर्मकों में से एक हैं, जिनमें जबरदस्त संख्या में कारक होते हैं जिन्हें क्रॉस रिएक्टिविटी सहित किसी भी प्रयोग में नियंत्रित किया जाना चाहिए। एंटीबॉडी कई एपिटोप्स और आत्मीयता को पहचानती है, जो पीएच, विलायक, ऊतक की स्थिति इत्यादि जैसे प्रयोगात्मक स्थितियों के आधार पर व्यापक रूप से भिन्न हो सकती है। शोधकर्ताओं ने एंटीबॉडी को मान्य करने के तरीके और एंटीबॉडी पर रिपोर्ट करने के तरीके दोनों में सुधार करने के लिए कई प्रयास किए हैं। अपने काम में एंटीबॉडी का उपयोग करने वाले शोधकर्ताओं को अपने शोध को पुनरुत्पादित करने (और इसलिए अन्य शोधकर्ताओं द्वारा परीक्षण और योग्य) की अनुमति देने के लिए उन्हें सही ढंग से रिकॉर्ड करने की आवश्यकता है। अकादमिक पेपरों में संदर्भित आधे से भी कम शोध एंटीबॉडी को आसानी से पहचाना जा सकता है। 2014 और 2015 में एफ1000 में प्रकाशित पेपर शोधकर्ताओं को अनुसंधान एंटीबॉडी उपयोग की रिपोर्टिंग के लिए एक गाइड प्रदान करते हैं। आरआरआईडी पेपर, 4 पत्रिकाओं में सह-प्रकाशित है, जिन्होंने अनुसंधान संसाधन उद्धरण के लिए आरआरआईडी मानक लागू किया है, जो एंटीबॉडी पहचानकर्ताओं के स्रोत के रूप में एंटीबॉडीरजिस्ट्री.ओआरजी से डेटा खींचता है (फोर्स 11 पर समूह भी देखें)