आउटपुट एक ऐसी कहानी है जिसमें एक चरित्र शामिल है जो समय के माध्यम से यात्रा करता है।
उसे अपनी यात्रा में कई टेस्ट पेरा पार करने पड़ते हैं, जैसे कि वह उन वक्तों में रुक जाए जब वह कुछ सोच रहा होता है अथवा अगली कार्रवाई की योजना बना रहा होता है। उसे इस यात्रा में दो अन्य चरित्रों से भी मुलाकात होती है, जैसे एक लंबी बालों वाली लड़की और एक भटकता हुआ शख्स।

इस यात्रा में चरित्र को अपनी निरंतर बड़ी पीड़ाओं का सामना करना पड़ता है, लेकिन उसे धीरे-धीरे सीख मिलती है कि उसे अपने सुख-दुःख को सामतुल्य ढंग से स्वीकार करना होगा। फिर भी, अंत में चरित्र को स्पष्ट होता है कि यह यात्रा उसे बेहतरीन अवसर देने वाला सफर था जो उसे अगले चरण पर ले जाता है।