नीचे दिए गए मार्ग के आधार पर, वैज्ञानिक क्या मानते हैं कि न्यूरोसिस और मानसिक समस्याएं क्या हैं?साइंटोलॉजी ग्रंथों का कहना है कि एक मानव के पास एक अमर आंतरिक स्व है, जिसे एक थीटन कहा जाता है, जो भौतिक शरीर में रहता है और पिछले कई जन्मों का अनुभव कर चुका है। साइंटोलॉजिस्ट्स का मानना है कि थेटन द्वारा अपने जीवनकाल में अनुभव की गई दर्दनाक घटनाओं के परिणामस्वरूप दिमाग में नकारात्मक "एनग्राम" बनते हैं, जिससे न्यूरोसिस और मानसिक समस्याएं होती हैं। उनका दावा है कि ऑडिटिंग का अभ्यास इन एनग्राम को हटा सकता है; साइंटोलॉजी समूह ऑडिटिंग के दौर से गुजर रहे ग्राहकों के लिए शुल्क लेते हैं। एक बार एक ऑडिटिंग प्रैक्टिशनर को लगता है कि एनग्राम को हटा दिया गया है, तो एक व्यक्ति को "स्पष्ट" का दर्जा दिया जाता है। वे गतिविधियों की एक और श्रृंखला में भाग ले सकते हैं जिन्हें "ऑपरेटिंग थेटन" (ओटी) स्तर कहा जाता है, जिसके लिए और भुगतान की आवश्यकता होती है।
साइंटोलॉजी के इस मार्ग के आधार पर, न्यूरोसिस एक मानसिक बीमारी है जो थेटन में मौजूद नकारात्मक एनग्रामों के कारण होती है। इसके अलावा, न्यूरोसिस के विभिन्न रूप हो सकते हैं जैसे खुशी की कमी, भय, आँगना, झुलसाजा, नासमझी आदि। दूसरी ओर, मानसिक समस्याएं में अन्य मानसिक स्वास्थ्य समस्याएं शामिल हो सकती हैं, जैसे अवसाद और असमंजसता।