स्कूल पहली बार 1962 में मैरीमाउंट कॉलेज के रूप में खुला, जो एक महिला जूनियर कॉलेज था जिसकी स्थापना रिलिजियस ऑफ द सेक्रेड हार्ट ऑफ मैरी (आरएसएचएम) द्वारा की गई थी। वित्तीय कठिनाई के कारण मैरीमाउंट कॉलेज ने अपनी लाइब्रेरी की किताबें बेचने की मांग की। डोनाल्ड ई. रॉस ने पुस्तकालय खरीदने के लिए परिसर का दौरा किया, लेकिन वह स्कूल से इतने प्रेरित हुए कि उन्होंने यहीं रहने और इसे सफल बनाने में मदद करने का फैसला किया। 1971 में, संक्रमण का दौर शुरू हुआ और स्कूल को एक ले बोर्ड के नियंत्रण में रखा गया। उस समय, डोनाल्ड ई. रॉस को राष्ट्रपति नामित किया गया था। 1974 में, नाम बदलकर बोका रैटन कॉलेज कर दिया गया। कॉलेज को 1986 में लेवल II पर मान्यता प्रदान की गई थी। 1988 में, इसे लेवल III पर मान्यता दी गई थी। इस समय के दौरान, इसे दो साल के स्कूल से मास्टर कार्यक्रम के साथ चार साल के कॉलेज में बदल दिया गया।

बोका रैटन में लिन विश्वविद्यालय का प्रवेश
बोका रैटन कॉलेज अपने संरक्षक, लिन परिवार का सम्मान करने के लिए 1991 में लिन विश्वविद्यालय बन गया।

2003-2004 में, डोनाल्ड ई. रॉस को $5,000,000 से अधिक का वेतन दिया गया, जिससे वह उस समय देश में सबसे अधिक वेतन पाने वाले कॉलेज या विश्वविद्यालय के अध्यक्ष बन गये। लिन यूनिवर्सिटी ने रॉस के प्रदर्शन और 35 साल की सेवा अवधि को ध्यान में रखते हुए उसके लिए एक न्यायसंगत सेवानिवृत्ति मुआवजा पैकेज निर्धारित करने के लिए राष्ट्रीय लेखा फर्म केपीएमजी को बरकरार रखा ("उनकी योजनाबद्ध जून 2006 की सेवानिवृत्ति के लिए 4.5 मिलियन डॉलर से अधिक अलग रखा गया था - नकदी का एक प्रवाह जिसे बनाने के लिए डिज़ाइन किया गया था) बजट संबंधी चिंताओं के कारण दशकों से कोई सेवानिवृत्ति लाभ आवंटित नहीं किया जा रहा है)। यह विश्वविद्यालय के लिए बंदोबस्ती का एक तिहाई था। 1 जुलाई 2006 को, रॉस विश्वविद्यालय के अध्यक्ष के रूप में 35 वर्षों के बाद सेवानिवृत्त हुए; केविन एम. रॉस अपने पिता के उत्तराधिकारी बने।

22 अक्टूबर 2012 को, विश्वविद्यालय ने अमेरिकी विदेश नीति के संबंध में अमेरिकी राष्ट्रपति बराक ओबामा और मैसाचुसेट्स के पूर्व गवर्नर मिट रोमनी के बीच तीसरी और अंतिम 2012 अमेरिकी राष्ट्रपति बहस की मेजबानी की। यह बहस कीथ सी. और ऐलेन जॉनसन वर्ल्ड परफॉर्मिंग आर्ट्स सेंटर में आयोजित की गई थी और इसका संचालन सीबीएस न्यूज़ के पत्रकार बॉब शिफ़र ने किया था।
2003-2004 में, डोनाल्ड ई. रॉस को $5,000,000 से अधिक का वेतन दिया गया, जिससे वह उस समय देश में सबसे अधिक वेतन पाने वाले कॉलेज या विश्वविद्यालय के अध्यक्ष बन गये।
स्कूल पहली बार 1962 में मैरीमाउंट कॉलेज के रूप में खुला, जो एक महिला जूनियर कॉलेज था जिसकी स्थापना रिलिजियस ऑफ द सेक्रेड हार्ट ऑफ मैरी (आरएसएचएम) द्वारा की गई थी। वित्तीय कठिनाई के कारण मैरीमाउंट कॉलेज ने अपनी लाइब्रेरी की किताबें बेचने की मांग की। डोनाल्ड ई. रॉस ने पुस्तकालय खरीदने के लिए परिसर का दौरा किया, लेकिन वह स्कूल से इतने प्रेरित हुए कि उन्होंने यहीं रहने और इसे सफल बनाने में मदद करने का फैसला किया। 1971 में, संक्रमण का दौर शुरू हुआ और स्कूल को एक ले बोर्ड के नियंत्रण में रखा गया। उस समय, डोनाल्ड ई. रॉस को राष्ट्रपति नामित किया गया था। 1974 में, नाम बदलकर बोका रैटन कॉलेज कर दिया गया। कॉलेज को 1986 में लेवल II पर मान्यता प्रदान की गई थी। 1988 में, इसे लेवल III पर मान्यता दी गई थी। इस समय के दौरान, इसे दो साल के स्कूल से मास्टर कार्यक्रम के साथ चार साल के कॉलेज में बदल दिया गया।

बोका रैटन में लिन विश्वविद्यालय का प्रवेश
बोका रैटन कॉलेज अपने संरक्षक, लिन परिवार का सम्मान करने के लिए 1991 में लिन विश्वविद्यालय बन गया।

2003-2004 में, डोनाल्ड ई. रॉस को $5,000,000 से अधिक का वेतन दिया गया, जिससे वह उस समय देश में सबसे अधिक वेतन पाने वाले कॉलेज या विश्वविद्यालय के अध्यक्ष बन गये। लिन यूनिवर्सिटी ने रॉस के प्रदर्शन और 35 साल की सेवा अवधि को ध्यान में रखते हुए उसके लिए एक न्यायसंगत सेवानिवृत्ति मुआवजा पैकेज निर्धारित करने के लिए राष्ट्रीय लेखा फर्म केपीएमजी को बरकरार रखा ("उनकी योजनाबद्ध जून 2006 की सेवानिवृत्ति के लिए 4.5 मिलियन डॉलर से अधिक अलग रखा गया था - नकदी का एक प्रवाह जिसे बनाने के लिए डिज़ाइन किया गया था) बजट संबंधी चिंताओं के कारण दशकों से कोई सेवानिवृत्ति लाभ आवंटित नहीं किया जा रहा है)। यह विश्वविद्यालय के लिए बंदोबस्ती का एक तिहाई था। 1 जुलाई 2006 को, रॉस विश्वविद्यालय के अध्यक्ष के रूप में 35 वर्षों के बाद सेवानिवृत्त हुए; केविन एम. रॉस अपने पिता के उत्तराधिकारी बने।

22 अक्टूबर 2012 को, विश्वविद्यालय ने अमेरिकी विदेश नीति के संबंध में अमेरिकी राष्ट्रपति बराक ओबामा और मैसाचुसेट्स के पूर्व गवर्नर मिट रोमनी के बीच तीसरी और अंतिम 2012 अमेरिकी राष्ट्रपति बहस की मेजबानी की। यह बहस कीथ सी. और ऐलेन जॉनसन वर्ल्ड परफॉर्मिंग आर्ट्स सेंटर में आयोजित की गई थी और इसका संचालन सीबीएस न्यूज़ के पत्रकार बॉब शिफ़र ने किया था।