मैनसन ने 1989 में फ्लोरिडा में मैरीलिन मैनसन ऐंड द स्पूकी किड्स का गठन किया (1992 में इस नाम को छोटा कर मैरीलिन मैनसन कर दिया गया). 'स्पूकी किड्स' के दरम्यान जोर्डी व्हाईट (जो ट्विगी रामिरेज के नाम से भी जाने जाते हैं) और एस्टिफेन ग्रेगरी बियर जूनियर (जो मडोना वेन गेसी के नाम से भी जाने जाते हैं) के साथ दो 'साइड प्रोजेक्ट्स' में वह संलग्न रहे। ये प्रोजेक्ट्स थे: सैटन ऑन फायर, जो की एक 'नकली-क्रिश्चन मेटल संगीतकारों का समूह' था और जिसमें उन्होंने बेस गिटार बजाया और मिसेज स्कैबट्री, एक बैंड जिसका गठन उन्होंने व्हाईट और तब की उनकी गर्लफ्रेंड जेसिका के सहयोग से किया था और जिसमे उन्होंने ड्रम बजाया था। इस (मिसेज स्कैबट्री) बैंड का गठन उन अनुबंधों से निबटने के लिए किया गया था जिनके अंतर्गत मैरीलिन मैनसन को कुछ ख़ास क्लबों में प्रदर्शन पर मनाही थी। 1993 की गर्मियों में, बैंड ने ट्रेंट रेज्नर का ध्यान अपनी ओर आकर्षित किया। रेज्नर ने 1994 के उनके 'डेब्यू' (प्रथम) एल्बम, पोट्रेट ऑफ़ अन अमेरिकन फॅमिली को प्रस्तुत किया और इसे अपने नथिंग रिकॉर्ड्स लेबल पर जारी किया। बैंड ने एक कल्ट अनुगमन का सिलसिला शुरू किया जिसने कि 1995 में स्मेल्स लाइक चिल्ड्रेन की रिलीज के साथ और वृहद् रूप ले लिया। उस EP ने बैंड को "स्वीट ड्रीम्स (आर मेड ऑफ़ दिस)"- जो 1983 के यूरिदमिक्स हिट का एक कवर था- के साथ MTV का पहला बड़ा हिट प्रदान किया। ऐंटीक्राइस्ट सुपर स्टार (ट्रेंट रेज्नर द्वारा सह-निर्मित) और भी बड़ी सफलता बन कर सामने आया।अकेले US में ही बैंड के तीन एलबम्स को प्लैटिनम सर्टिफिकेशन से, तथा तीन और को गोल्ड से नवाज़ा गया है। बैंड के तीन रिलीजों ने टॉप टेन में डेब्यू किया जिसमें से दो नंबर-वन एलबम रहे। मैनसन ने पहले बैंड जैक ऑफ़ जिल के साथ निर्माता के रूप में काम किया। उन्होंने बैंड का नाम रखने में सहायता की और बैंड के अधिकतर प्रारम्भिक रिकॉर्डिंगों के निर्माता बने। उन्होंने गीत "माय कैट" में गिटार भी बजाया और बैंड को उनके दक्षिण फ्लोरिडा के ज्यादातर शोज़ को शुरू करने का श्रेय दिया।  मैनसन ने बाद में बैंड के एलबम ह्युमिड टीनेज मीडियोक्रिटी 1992-1995, प्रारंभिक जैक ऑफ़ जिल रिकॉर्डिंग्स के एक संग्रह में लाइनर नोट्स लिखे. मैनसन, DMX के एलबम फ्लेश ऑफ़ माई फ्लेश, ब्लड ऑफ़ माई ब्लड और गॉडहेड के 2000 इयर्स ऑफ़ ह्यूमन एरर एलबम —— उनके वैनिटी लेबल पोस्टह्यूमन में जारी किया गया एकमात्र एलबम में अतिथि कलाकार के रूप में दिखाई हैं।
ट्रेंट रेज्नर
मैनसन ने 1989 में फ्लोरिडा में मैरीलिन मैनसन ऐंड द स्पूकी किड्स का गठन किया (1992 में इस नाम को छोटा कर मैरीलिन मैनसन कर दिया गया). 'स्पूकी किड्स' के दरम्यान जोर्डी व्हाईट (जो ट्विगी रामिरेज के नाम से भी जाने जाते हैं) और एस्टिफेन ग्रेगरी बियर जूनियर (जो मडोना वेन गेसी के नाम से भी जाने जाते हैं) के साथ दो 'साइड प्रोजेक्ट्स' में वह संलग्न रहे। ये प्रोजेक्ट्स थे: सैटन ऑन फायर, जो की एक 'नकली-क्रिश्चन मेटल संगीतकारों का समूह' था और जिसमें उन्होंने बेस गिटार बजाया और मिसेज स्कैबट्री, एक बैंड जिसका गठन उन्होंने व्हाईट और तब की उनकी गर्लफ्रेंड जेसिका के सहयोग से किया था और जिसमे उन्होंने ड्रम बजाया था। इस (मिसेज स्कैबट्री) बैंड का गठन उन अनुबंधों से निबटने के लिए किया गया था जिनके अंतर्गत मैरीलिन मैनसन को कुछ ख़ास क्लबों में प्रदर्शन पर मनाही थी। 1993 की गर्मियों में, बैंड ने ट्रेंट रेज्नर का ध्यान अपनी ओर आकर्षित किया। रेज्नर ने 1994 के उनके 'डेब्यू' (प्रथम) एल्बम, पोट्रेट ऑफ़ अन अमेरिकन फॅमिली को प्रस्तुत किया और इसे अपने नथिंग रिकॉर्ड्स लेबल पर जारी किया। बैंड ने एक कल्ट अनुगमन का सिलसिला शुरू किया जिसने कि 1995 में स्मेल्स लाइक चिल्ड्रेन की रिलीज के साथ और वृहद् रूप ले लिया। उस EP ने बैंड को "स्वीट ड्रीम्स (आर मेड ऑफ़ दिस)"- जो 1983 के यूरिदमिक्स हिट का एक कवर था- के साथ MTV का पहला बड़ा हिट प्रदान किया। ऐंटीक्राइस्ट सुपर स्टार (ट्रेंट रेज्नर द्वारा सह-निर्मित) और भी बड़ी सफलता बन कर सामने आया।अकेले US में ही बैंड के तीन एलबम्स को प्लैटिनम सर्टिफिकेशन से, तथा तीन और को गोल्ड से नवाज़ा गया है। बैंड के तीन रिलीजों ने टॉप टेन में डेब्यू किया जिसमें से दो नंबर-वन एलबम रहे। मैनसन ने पहले बैंड जैक ऑफ़ जिल के साथ निर्माता के रूप में काम किया। उन्होंने बैंड का नाम रखने में सहायता की और बैंड के अधिकतर प्रारम्भिक रिकॉर्डिंगों के निर्माता बने। उन्होंने गीत "माय कैट" में गिटार भी बजाया और बैंड को उनके दक्षिण फ्लोरिडा के ज्यादातर शोज़ को शुरू करने का श्रेय दिया।  मैनसन ने बाद में बैंड के एलबम ह्युमिड टीनेज मीडियोक्रिटी 1992-1995, प्रारंभिक जैक ऑफ़ जिल रिकॉर्डिंग्स के एक संग्रह में लाइनर नोट्स लिखे. मैनसन, DMX के एलबम फ्लेश ऑफ़ माई फ्लेश, ब्लड ऑफ़ माई ब्लड और गॉडहेड के 2000 इयर्स ऑफ़ ह्यूमन एरर एलबम —— उनके वैनिटी लेबल पोस्टह्यूमन में जारी किया गया एकमात्र एलबम में अतिथि कलाकार के रूप में दिखाई हैं।