QD 와 염료 - 표지 된 DNA 사이 의 높 은 컨 쥬게 이 션 ( FRET ) 효율 을 달성 하 기 위하 여 , QD 수용 성 으로 만들 기 위해 사용 되 었 던 과잉 의 결합 되 지 않 은 MPA 를 제거 할 필요 가 있 다 . 과잉 의 MPA 의 제거 는 에탄올 을 사용 하 여 침전 시킨 다음 14 , 000 rpm 에서 20 분 동안 원심 분리 함 으로써 달성 된다 . 결합 되 지 않 은 MPA 는 에탄올 에서 가용성 이 지만 MPA - QD 는 원심 분리 조건 하 에서 그렇 지 않 다 . 과잉 의 MPA 의 제거 는 MPA 로부터 QD 결합 에 대한 경쟁 을 제거 하 였으며 , QD 에 대한 DNA 의 컨 쥬게 이 션 효율 을 고도 로 증가 시켰 다 . DNA 대 QD 의 상이 한 비 에서 QD - DNA 컨 쥬 게이트 의 형광 스펙트럼 을 도 3 a 에 도시 하 였 다 . QD 에 대한 염료 - 표지 된 DNA 의 컨 쥬게 이 션 은 560 nm 에서 공 여체 ( QD ) 형광 을 소멸 시킨 반면 , 동일 시간 대 에 FRET 을 통해 618 nm 에서 수용체 ( 염료 ) 형광 을 증진 시켰 다 . I A / ( I A + I D ) 로서 정의 된 ( 여기 서 , I A 및 I D 는 수용체 및 공 여체 강도 ) 추정 된 FRET 효율 은 초기 DNA 대 QD 의 비와 더불 어 증가 하 였으나 , 0 . 5 의 DNA : QD 비 에서 신속 하 게 안정 되 었 으며 , 여기 서 ~ 50 % FRET 효율 이 수득 되 었 다 ( 도 3 b 참조 ) . FRET 효율 은 단 일 공 여체 와 상호 작용 하 는 n 동일 한 수용체 를 가진 FRET 에 대한 방정식 E = nR 0 6 / ( nR 0 6 + r 6 ) 으로부터 예상 된 것 보다 높 았 다 ( 상기 문헌 : 4 ) . FRET 효율 과 상기 방정식 을 사용 함 으로써 , 본 발명자 들 은 0 . 25 , 0 . 50 , 1 . 0 및 2 . 0 의 DNA : QD 비 에 대한 평균 공 여체 - 수용체 거리 r 을 각각 4 . 10 , 3 . 80 , 4 . 33 및 4 . 60 nm 로 추정 하 였 다 . QD 의 크기 를 고려 하 고 DNA 가 연장 되 어 있 는 것 으로 추정 하 여 염료 로부터 QD 중앙 까지 의 예측 된 거리 는 4 . 60 nm 였 다 . 따라서 , 상기 실험 값 은 2 의 DNA : QD 비 에서 만 예측 과 일치 하 였 고 , 그 밖 의 다른 비 에서 는 수득 된 거리 가 예측 치 보다 훨씬 작 았 다 .