펩티드 샘플 들 은 Lee et al . , ( 2004 ) Plant Cell 16 , 1378 - 1391 에서 제시 한 방법 으로 준비 되 었 다 . 펩티드 질량 은 MALDI - TOF MS 시스템 ( Voyager - DE STR ; Applied Biosystems ) 으로 측정 되 었 고 그 finger print 데이터 는 MS - Fit 프로그램 을 사용 하 여 NCBI 의 non - redundant database 에서 일치 시켰 다 . 분석 은 mass tolerance 50 ppm , 불 완전 한 cleavage 1 개 로 설정 하 였 다 . N 말단 부위 의 acetylation , carbamidomethylation 에 의한 Cys 의 alkylation , Met 의 oxidation , 그리고 N 말단 부위 Gln 의 pyroGlu 형성 은 모두 가능 한 변형 으로 설정 하 였 다 . 분자량 과 pI 는 각각 10 ~ 200 kD 과 4 ~ 7 로 설정 하 였 다 . 예상 된 단백질 은 5 가지 펩티드 일치 와 15 % 이상 서열 일치 , 분자량 탐색 수 103 이상 일 때 동일 함 을 확실시 하 였 다 .