커플링 후 , 포스 포르 아미 다 이 트 올리 고 뉴클레오티드 합성 방법 은 임의 적 으로 캡 핑 단계 를 포함 한다 . 캡 핑 단계 에서 , 성장 하 는 올리 고 뉴클레오티드 는 캡 핑 제 로 처리 된다 . 일반 적 으로 , 캡 핑 단계 는 커플링 후 미 반응 기판 - 결합 된 5 '- OH 기 가 추가 로 쇄 연장 되 지 않 도록 하 여 내부 염기 결실 을 가진 올리 고 뉴클레오티드 의 형성 을 방지 한다 . 또한 , 1 H - 테트라 졸 로 활성 화 된 포스 포르 아미 다 이트 는 종종 소량 으로 구아노신 의 O 6 위치 와 반응 한다 . 이론 에 구애 됨 이 없이 , I 2 / 물 로 산화 시 , 이 부산물 은 가능 하 게 는 O 6 - N 7 이동 에 의해 탈 퓨 린 화 를 겪 는다 . 탈 퓨 린 부위 는 올리 고 뉴클레오티드 의 최종 탈 보호 의 과정 중 에 절단 되 어 전장 생성물 의 수율 을 감소 시킬 수 있 다 . O 6 변형 은 I 2 / 물 에 의한 산화 이전 에 캡 핑 시약 으로 처리 함 으로써 제거 될 수 있 다 . 일부 경우 에 , 올리 고 뉴클레오티드 합성 동안 캡 핑 단계 가 포함 되 면 캡 핑 이 없 는 합성 에 비해 에러 율 이 감소 된다 . 한 예 로서 , 캡 핑 단계 는 기판 - 결합 된 올리 고 뉴클레오티드 를 아세트산 무수물 과 1 - 메틸 이미다졸 의 혼합물 로 처리 하 는 것 을 포함 한다 . 캡 핑 단계 후 , 기판 은 임의 적 으로 세척 된다 .