" 용어 "" 실질 적 인 동일 성 "" 은 2 개 펩타이드 서열 이 최적 으로 정렬 되 는 경우 ( 예 를 들 어 ", 디폴트 갭 가중치 를 사용 한 프로그램 GAP 또는 BESTFIT 에 의해 ) 65 % 이상 의 서열 동일 성 , 바람직 하 게 는 80 또는 90 % 이상 의 서열 동일 성 , 보다 바람직 하 게 95 % 이상 의 서열 동일 성 ( 예 를 들 어 , 99 % 이상 의 서열 동일 성 ) 을 공유 함 을 의미 한다 . 바람직 하 게 , 동일 하 지 않 은 잔기 위치 는 보존 성 아미노산 치환 에 의해 상이 하 다 .