특정 구 현예 에서 , 엔 도 뉴클레아제 에 의해 유도 된 DNA 절단 은 유입 서열 로 복구 / 대체 된다 . 예 를 들 어 , 전술 한 Cas 9 발현 카세트 및 gRNA 발현 카세트 에 의해 생성 된 DNA 절단 을 정밀 하 게 복구 하 기 위해 뉴클레오티드 편집 템플 릿 이 제공 되 어 , 세포 의 DNA 복구 기 작 ( DNA repair machinery ) 이 편집 템플 릿 을 사용 할 수 있 다 . 예 를 들 어 , 표적 화 된 유전자 의 5 ’ 에 있 는 약 500 bp 가 표적 화 된 유전자 의 3 ’ 에 있 는 약 500 bp 에 융합 되 어 편집 템플 릿 을 생성 할 수 있 고 , 이 템플 릿 은 바실 러스 숙주 의 기 작 에 의해 사용 되 어 RGEN 에 의해 생성 된 DNA 절단 을 복구 한다 .