목적 으로 하 는 DNA 영역 ( 즉 , 목적 영역 ) 은 , GC 풍부 한 염기 배열 이 많 기 때문 에 , 때로 는 , 베타 인 , DMSO 등 을 적당량 첨가 하 여 반응 을 실시 해도 된다 . 반응 조건 으로 는 , 예 를 들 면 , 상기 와 같 은 반응 액 을 , 95 ℃ 에서 10 분 간 보온 한 후 , 95 ℃ 에서 30 초간 , 이어서 55 ∼ 65 ℃ 에서 30 초간 , 다시 72 ℃ 에서 30 초간 을 1 사이클 로 하 는 보온 을 30 ∼ 40 사이클 행하 는 조건 을 들 수 있 다 . 이러 한 PCR 을 행한 후 , 얻 어 진 증폭 산물 을 검출 한다 . 예 를 들 면 , 미리 표식 된 프라이머 를 사용 한 경우 에 는 , 먼저 와 동일 한 세정 · 정제 조작 을 실시 후 , 형광 표 식체 의 양 의 측정 에 의해 PCR 반응 에서 의 증폭 량 을 평가 할 수 있 다 . 또한 , 표식 되 어 있 지 않 은 통상 의 프라이머 를 이용 한 PCR 을 실시 한 경우 는 , 금 콜로이드 입자 , 형광 등 으로 표식 한 프로브 ( probe ) 등 을 어닐링 시키 고 , 목적 영역 에 결합 한 당해 프로브 의 양 을 측정 함 으로써 검출 할 수 있 다 . 또 , 증폭 산물 의 양 을 보다 정밀 도 좋 게 구하 기 위해서 는 , 예 를 들 면 , 실시간 PCR 법 을 이용 하 면 된다 . 실시간 PCR 법 은 , PCR 을 실시간 으로 모니터 하 고 , 얻 어 진 모니터 결과 를 동역학 ( kinetics ) 분석 하 는 방법 이 며 , 예 를 들 면 , 유전자량 에 관해서 2 배 정도 의 매우 근소 한 차이 도 검출 할 수 있 는 고정 밀도 의 정량 PCR 법 으로서 알려진 방법 이 다 . 당해 실시간 PCR 법 에 는 , 예 를 들 면 , 주형 의존 성 핵산 폴리머 라 아제 프로브 등 의 프로브 를 이용 하 는 방법 , 사이버 그린 ( SYBR - Green ) 등 의 인터칼 레이터 ( intercalator ) 를 이용 하 는 방법 등 을 들 수 있 다 . 실시간 PCR 법 을 위한 장치 및 키트 는 시판 되 는 것 을 이용 해도 된다 . 이상 과 같이 , 검출 에 대해서 는 특별히 한정 되 지 않 고 , 지금 까지 주지 의 모든 방법 에 의한 검출 이 가능 하 다 . 이 들 방법 에서 는 , 반응 용기 를 바꿔 옮기 지 않 고 검출 까지 의 조작 이 가능 해진다 .