상기 RNA 대체 이 어 맞추 기 ( alternative RNA splicing ) 에서 는 , RNA splicing pattern 이 뇌 , 간 , 신장 등 각 장기 마다 , 장기 의 각 조직 마다 다른 조합 을 나타낼 수 있 다 . 또한 질병 의 원인 돌연변이 중 15 ~ 60 % 정도 는 이러 한 splicing 에 영향 을 주 는 것 으로 알려져 있 다 . 그러므로 한 유전자 에 대한 RNA 서열 분석 의 결과 를 분석 하 면 유전자 를 발현 하 는 DNA 상 의 엑손 ( exone ) 의 배열 순서 를 알아낼 수 있 다 .