본 발명 에서 이용 되 는 뉴클레오타이드 변이 특이 적 프라이머 는 기본 적 으로 일반식 I 의 구조 를 갖 도록 하 여 , 매우 높 은 특이 성 으로 타깃 서열 과 혼성 화 되 도록 하 였 다 . 이러 한 , 일반식 I 의 구조 를 갖 는 프라이머 에서 두 개 의 특이 성 구역 은 분할 구역 에 의해 물리 적 으로 그리고 기능 적 으로 분할 되 며 , 프라이머 전체 구조 의 혼성 화 특이 성 은 변이 인접 특이 성 구역 과 변이 특이 성 구역 에 의해 이중 적 으로 조절 된다 . 또한 , 뉴클레오타이드 변이 에 해당 되 거나 또는 변이 에 혼성 화 되 는 염기 는 변이 특이 성 구역 의 중앙 부분 에 위치 하 도록 하 여 , 미스 매치 에 따른 Tm 값 차이 를 크 게 하 면서 도 미스 매치 시 Taq 중합효소 에 의한 DNA 합성 이 되 지 않 도록 하 였 다 .