본 발명 측정 방법 에 있 어서 의 「 메틸화 감수 성 제 한 효소 」 란 , 예 를 들 면 , 메틸 화 된 사이토신 을 포함 하 는 인식 배열 을 소화 하 지 않 고 , 메틸 화 되 어 있 지 않 은 사이토신 을 포함 하 는 인식 배열 만 을 소화 할 수 있 는 제한 효소 등 을 의미 한다 . 즉 , 메틸화 감수 성 제 한 효소 가 본래 인식 할 수 있 는 인식 배열 에 포함 되 는 사이토신 이 메틸 화 되 어 있 는 DNA 인 경우 에 는 , 당해 메틸화 감수 성 제 한 효소 를 당해 DNA 에 작용 시켜도 , 당해 DNA 는 절단 되 지 않 는다 . 이 에 대해서 , 메틸화 감수 성 제 한 효소 가 본래 인식 할 수 있 는 인식 배열 에 포함 되 는 사이토신 이 메틸 화 되 어 있 지 않 은 DNA 인 경우 에 는 , 당해 메틸화 감수 성 제 한 효소 를 당해 DNA 에 작용 시키 면 , 당해 DNA 는 절단 된다 . 이러 한 메틸화 감수성 효소 의 구체 적 인 예 로 는 , 예 를 들 면 , Hpa Ⅱ , BstUI , Nar Ⅰ , Sac Ⅱ , Hha Ⅰ 등 을 들 수 있 다 . 또한 , 상기 의 메틸화 감수 성 제 한 효소 는 , 헤미 메틸 ( hemimethyl ) 상태 의 CpG 쌍 을 포함 하 는 이중 가닥 DNA ( 즉 , 상기 CpG 쌍 중 , 한 쪽 가닥 의 사이토신 이 메틸 화 되 어 있 고 , 다른 쪽 가닥 의 사이토신 이 메틸 화 되 어 있 지 않 은 이중 가닥 DNA ) 를 절단 하 지 않 은 것 이 며 , 이미 Gruenbaum 등 에 의해 명백 하 게 되 어 있 다 ( Nucleic Acid Research , 9 , 2509 － 2515 ) . 또한 , 예 를 들 면 , 단일 가닥 DNA 중 의 메틸 화 된 사이토신 을 포함 하 는 인식 배열 을 소화 하 지 않 고 , 메틸 화 되 어 있 지 않 은 사이토신 을 포함 하 는 인식 배열 만 을 소화 할 수 있 는 제한 효소 , 즉 , 메틸화 감수 성 제 한 효소 중 에 는 , 단일 가닥 DNA 를 소화 하 는 것 도 있 다 . 예 를 들 면 , Hha Ⅰ 등 을 들 수 있 다 .