돌연변이 는 전형 적 으로 선행 기술 펩타이드 백신 에 대한 네오 - 에 피토프 를 유도 하 기 위해 환자 의 DNA 서열 분석 데이터 로부터 얻 어 진다 . 그러나 , mRNA 발현 은 가능 한 네오 - 에 피토프 의 전반 적 공간 의 더 직접 적 인 측정 이 다 . 예 를 들 어 , 일부 종양 - 특이 적 네오 - 에 피토프 는 스 플라 이싱 변화 , 삽입 / 결실 ( InDel ) 로부터 생겨서 프레임 시프트 , 대안 의 프로모터 , 또는 엑 솜 서열 분석 만 을 이용 하 여 용이 하 게 동정 되 지 않 는 후성 적 변형 을 초래 할 수 있 다 . 신생 항원 백신 에 대한 복잡 한 돌연변이 의 이 들 유형 을 동정 함 에 있 어서 이용 되 지 않 은 값 이 있 는데 , 그 들 이 환자 의 독특 한 HLA 알 로 타이프 에 결합 할 수 있 는 에 피토프 수 를 증가 시킬 것 이 기 때문 이 다 . 게다가 , 복잡 한 변이체 는 더 면역원성 일 것 이 고 , 단일 아미노산 변화 로부터 초래 된 변이체 에 비해 자기 단백질 로부터 의 그 들 의 차이 에 기인 하 여 종양 에 대해 더 효과 적 인 면역 반응 을 야기 할 가능 성 이 있 다 .