초기 의 분자 동역학 시늉 실험 에서 는 딱딱 공 모형 의 유체 계 에 집중 되 었 으며 , 알더 와 바인 라이트 [ ALD 57 ] 에 의해 많 은 계산 이 이루 어 졌 다 . 그 후 셈 틀 의 발달 로 라만 [ RAH 64 ] , 버렛 [ VER 67 ] 등 에 의해 레나드 존스 와 같 은 연속 적 인 힘 을 받 는 유체 계 에 대해서 도 분자 동역학 시늉 실험 이 이루 어 졌 다 . 딱딱 공 모형 에 대한 분자 동역학 방법 은 입자 간 의 부딪힘 시간 이나 분자 동역학 기본 방 의 벽 과 의 부딪힘 시간 을 각각 계산 하 여 그 중 최소 시간 만큼 입자 를 이동 시키 는 셈법 을 사용 한다 . 따라서 입자 들 이 움직이 는 시간 간격 이 일정 하 지 않 게 된다 . 그러나 연속 적 인 상호 작용 인 경우 에 는 일정 한 시간 간격 만큼 입자 들 을 이동 하 여 힘 , 속도 와 위치 를 계속 계산 해 내 는 셈법 을 사용 한다 . 따라서 이 두 셈법 은 성질 상 상당히 배타 적 이 며 독립 적 이 다 . 즉 , 딱딱 공 에 대한 셈법 과 연속 퍼텐셜 에 대한 셈법 은 서로 별도 로 발전 되 어 왔 다 . 따라서 딱딱 공 에 인력 꼬리 가 있 는 경우 의 분자 동역학 은 별로 시도 된 적 이 없 다 . 딱딱 공 ＋ 인력 꼬리 인 경우 는 건드림 이론 ( perturbation theory ) 으로 취급 할 수 있 게 되 어 상당히 유용 하 다 .