NHEJ 는 돌연변이 유발 과정 이 기 때문 에 , 특정 최종 서열 의 생 성 이 필요 하 지 않 는 한 작 은 서열 모티프 를 결실 하 는 데 또한 사용 될 수 있 다 . 이중 가닥 절단 부이 짧 은 표적 서열 부근 으로 표적 화 되 는 경우 , NHEJ 수선 에 의해 야기 된 결실 돌연변이 는 종종 원 하 지 않 는 뉴클레오타이드 를 포괄 하 고 , 따라서 제거 한다 . 더 큰 DNA 부분 을 결실 하 기 위해 , 서열 의 각 편 상 에 하나 씩 2 개 의 이중 가닥 절 단부 을 도입 하 는 것 은 , 말단 들 사이 에 중간 서열 전체 가 제거 되 는 NHEJ 를 야기 할 수 있 다 . 이 들 접근 법 은 둘 모두 특정 DNA 서열 을 결실 하 는 데 사용 될 수 있 다 ; 그러나 , NHEJ 의 오류 - 빈발 성질 은 여전히 수선 부위 에 삽입 결실 돌연변이 를 생산 할 수 있 다 .