기질 의 길이 는 효과 적 인 에너지 전이 를 위하 여 결합 되 는 에너지 수용체 의 종류 및 형태 에 따라 소정 길 이 이하 가 되 어야 한다 . 즉 , 에너지 수용체 로서 금 나노 입자 를 사용 하 는 경우 에 는 양자 점 의 반지름 ( 7 . 5 ~ 10 nm ) 를 고려 하 여 기질 의 이론 적 길이 가 1 - 15 nm 이하 가 되 도록 하 는 것 이 적당 하 며 , 에너지 수용체 로서 형광 물질 을 이용 하 는 경우 에 는 1 - 5 nm 이하 가 되 도록 하 는 것 이 적당 하 나 예시 한 거리 조건 내 에서 짧 은 기질 을 사용 할수록 효과 적 인 에너지 전이 를 기대 할 수 있 다 . 그러나 기질 이 너무 짧 은 경우 와 기질 이 길 더라도 기질 내 가수 분해 되 는 위치 가 양자 점 쪽 에 치우쳐서 위치 해 있 을 경우 에 는 가수 분해 단백질 이 접근 이 어려워 반응 효율 이 낮 아 질 수 있 으므로 이 를 충분히 감안 해야 한다 . 기질 로서 펩타이드 를 사용 하 는 경우 , 금 나노 입자 를 에너지 수용체 로 사용 시 에 는 펩타이드 의 서열 이 20 개 이하 , 형광 물질 을 에너지 수용체 로 사용 시 에 는 펩타이드 서열 이 10 개 이하 인 것 이 바람직 하 다 . 펩타이드 길이 가 상기 개수 보다 많 은 경우 , 양자 점 과 수용체 간 의 거리 가 늘어나 효과 적 인 에너지 전이 가 발생 하 지 않 을 수 가 있 다 . 단 , 펩타이드 중 α - helix 구조 를 형성 하 는 것 으로 알려진 서열 ( 예 , achiral alpha - amino isobutyric residue ( Aib ) ) 을 포함 시키 거나 상기 언급 한 개수 이상 의 펩타이드 서열 에서 2 차 혹은 3 차 구조 를 형성 한다면 충분히 거리 가 줄어들 수 있 으므로 보다 많 은 수 의 펩타이드 서열 을 사용 할 수 있 다 .