본 개시 내용 의 폴리펩타이드 또는 폴리 뉴클레오타이드 는 기준 분자 ( 예 를 들 어 , 기준 폴리펩타이드 또는 기준 폴리 뉴클레오타이드 ) 와 , 예 를 들 어 , 당업 계 에 기재 된 분자 ( 예 를 들 어 , " 조작 되 거나 또는 설계 된 분자 또는 야생 형 분자 ) 와 소정 의 정도 의 서열 유사 성 또는 동일 성 을 공유 할 수 있 다 . 당업 계 에 공지 된 바 와 같 은 용어 "" 동일 성 "" 은 서열 을 비교 함 으로써 결정 되 는 2 이상 의 폴리펩타이드 또는 폴리 뉴클레오타이드 서열 사이 의 관계 를 지칭 한다 . 당업 계 에서 ", 동일 성 은 또한 2 이상 의 아미노산 잔기 또는 핵산 잔기 의 가닥 사이 의 매치 수 에 의해 결정 되 는 바 와 같 은 그 들 사이 의 서열 관련 성 정도 를 의미 한다 . 동일 성 은 특정 수학 적 모델 또는 컴퓨터 프로그램 ( 예 를 들 어 , " "" 알고리즘 "") 에 의해 처리 되 는 ( 만약 에 있 다면 ) 갭 정렬 에 의한 2 이상 의 서열 중 더 작 은 것 사이 의 동일 한 매치 의 백분율 을 측정 한다 . 관련 된 펩타이드 의 동일 성 은 공지 된 방법 에 의해 용이 하 게 계산 될 수 있 다 . "" 동일 성 %"" 는 그것 이 폴리펩타이드 또는 폴리 뉴클레오타이드 서열 에 적용 된다면 ", 필요 하 다면 최대 동일 성 백분율 을 달성 하 기 위해 서열 을 정렬 하 고 갭 을 도입 한 후 에 , 제 2 서열 의 아미노산 서열 또는 핵산 서열 내 찬기 와 동일 한 후보 아미노산 또는 핵산 서열 에서 의 잔기 ( 아미노산 잔기 또는 핵산 잔기 ) 의 백분율 로서 정의 된다 . 정렬 을 위한 방법 및 컴퓨터 프로그램 은 당업 계 에 잘 공지 되 어 있 다 . 동일 성 은 백분율 동일 성 의 계산 에 의존 하 지만 , 계산 에서 도입 된 갭 및 페널티에 기인 하 여 값 이 상이 할 수 있 다는 것 이 이해 된다 . 일반 적 으로 , 특정 폴리 뉴클레오타이드 또는 폴리펩타이드 의 변이체 는 본 명세서 에 기재 되 고 당업자 에게 공지 된 서열 정렬 프로그램 및 매개변수 에 의해 결정 하 여 특정 기준 폴리 뉴클레오타이드 또는 폴리펩타이드 에 대해 적어도 40 %, 45 %, 50 %, 55 %, 60 %, 65 %, 70 %, 75 %, 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 %, 그러나 100 % 미만 의 서열 동일 성 을 갖 는다 . 정렬 을 위한 이러 한 도구 는 BLAST 스위트 의 도구 를 포함 한다 ( Stephen F . Altschul , et al ( 1997 ) , " "" Gapped BLAST and PSI - BLAST : a new generation of protein database search programs """, Nucleic Acids Res . 25 : 3389 - 3402 ) . 다른 대중 적 인 국소 정렬 기법 은 스미스 - 워터 만 ( Smith - Waterman ) 알고리즘 에 기반 한다 ( Smith , T . F . & Waterman , " M . S . ( 1981 ) "" Identification of common molecular subsequences . "" J . Mol . Biol . 147 : 195 - 197 ) . 동적 프로그래밍 에 기반 한 일반 적 인 전반 적 정렬 기법 은 니 들 만 - 뷘시 ( Needleman - Wunsch ) 알고리즘 이 다 ( Needleman ", S . B . & Wunsch , " C . D . ( 1970 ) "" A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequences of two proteins . "" J . Mol . Biol . 48 : 443 - 453 . ) . 더 최근 에 알려진 바 에 의하 면 니 들 만 - 뷘시 알고리즘 을 포함 하 는 최적 의 전반 적 정렬 방법 이외 의 뉴클레오타이드 및 단백질 서열 의 전반 적 정렬 을 생성 하 는 빠른 최적 의 전반 적 서열 정렬 알고리즘 ( Fast Optimal Global Sequence Alignment Algorithm : FOGSAA ) 이 개발 되 었 다 . 다른 도구 가 본 명세서 에서 "," 구체 적 으로 는 이하 의 "" 동일 성 "" 의 정의 에 기재 된다 . "