게놈 DNA 는 비드 ( bead ) 를 사용 하 여 박테리아 펠 렛 에서 추출 하 였으며 , 페놀 - 클로로포름 - 이소아 밀 알코올 ( Biosesang , Seongnam , South Korea ) 과 클로로포름 을 사용 하 여 정제 하 였 다 . Solg 2 X EF - Taq PCR Smart Mix 2 ( Solgent , Seoul , Korea ) 를 사용 하 여 PCR 증폭 을 수행 하 였 다 . 16 S rRNA 유전자 는 박테리아 범용 프라이머 27 F 및 1492 R 로 증폭 시켰 다 ( Lane , 1991 ) . crtNM - for ( 5 '- C G C G G A A T T CATGAAGCAAGTATCGATTATTGGC - 3 ') 및 crtNM - rev ( 5 '- G A T C G A A T T CTTAAGCCTCCTTAAGGGCTAGTTC - 3 ') 에 대한 올리 고 뉴클레오타이드 프라이머 쌍 을 사용 하 여 PCR 을 이용 하 여 1 차 로 선별 된 황색 색소 를 갖 는 균주 에서 의 오페론 crtNM 의 존재 를 확인 하 였 다 . PCR 은 Turpin et al . ( 2016 ) 에서 언급 된 , 95 ℃ 에서 5 분 , 1 사이클 ; 95 ℃ 에서 30 초 , 60 ℃ 에서 30 초 , 72 ℃ 에서 120 초 40 사이클 ; 그 다음 72 ℃ 에서 5 분 , 1 사이클 로 T 100 thermal cycler ( Bio - Rad Laboratories , Hercules , CA , USA ) 를 사용 하 여 수행 하 였 다 . 상기 PCR 산물 은 Macrogen Co . ( Seoul , Korea ) 에 의해 서열 분석 되 었 다 . 16 S rRNA 유전자 와 crtNM 유전자 는 BLASTN 알고리즘 을 사용 하 여 GenBank ( NCBI ) 에서 동정 되 었 다 . 염기 서열 은 CLUSTALW 프로그램 을 사용 하 여 정렬 하 였 다 ( Thompson et al . , 1994 ) . 계통 발생 분석 은 MEGA 6 프로그램 으로 수행 되 었 다 .