유전자 의 조절 관계 를 예측 하 기 위해서 지금 까지 다양 한 방법 들 이 시도 되 어 왔 다 . 예컨대 , 유전자 프로파일 사이 의 유사 성 을 계산 하 는 여러 가지 방법 들 이 제안 되 었 다 . 다른 방법 으로서 , 시간 지연 을 고려 하 여 조절 관계 에 있 는 유전자 쌍 의 관계 패턴 을 고찰 하 는 방법 들 이 개발 되 었 다 . 또한 , 상기 분석 적 인 방법 들 과 는 달리 기계 학습 을 통해서 예측 하 는 방법 도 제안 되 었 다 .