전술 한 바 와 같이 , 상기 ( a ) ∼( c ) 에서 는 , 상기 의 목적 으로 하 는 DNA 영역 을 포함 하 는 단일 가닥 DNA 와 , 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 의 결합 후 , 생기 는 결합체 에 포함 되 는 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 와 스 트 렙 트 아 비딘 으로 피복 한 지 지체 를 결합 시켜 , 복합체 를 형성 하 고 있 지만 , 이 순서 에 한정 되 는 것 은 아니 다 . 즉 , 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 와 스 트 렙 트 아 비딘 으로 피복 한 지 지체 를 결합 시킨 후 , 생기 는 결합체 에 상기 의 목적 으로 하 는 DNA 영역 을 포함 하 는 단일 가닥 DNA 를 결합 시켜 , 복합체 를 형성 해도 된다 . 예 를 들 면 , 스 트 렙 트 아 비딘 으로 피복 한 지 지체 에 고정 화 된 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 에 , 생물 유래 검체 중 에 포함 되 는 게놈 DNA 유래 의 DNA 시료 에 포함 되 는 이중 가닥 DNA 를 첨가 함 으로써 , 지 지체 에 고정 화 된 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 와 당해 이중 가닥 DNA 의 혼합물 을 얻 는다 . 얻 어 진 혼합물 에 포함 되 는 당해 이중 가닥 DNA 를 분리 하 여 단일 가닥 DNA 를 얻 기 위해 , 당해 혼합물 을 95 ℃ 로 , 예 를 들 면 , 몇 분 간 가열 한다 . 얻 어 진 단일 가닥 DNA 와 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 의 결합체 를 형성 시키 기 위해 , 비오틴 화 본 올리 고 뉴클레오티드 의 Tm 값 의 약 10 ∼ 20 ℃ 낮 은 온도 까지 급속 하 게 냉각 하 고 , 그 온도 로 , 예 를 들 면 , 몇 분 간 보온 한다 . 그 후 , ( c ) 의 조작 을 실시 하 여 복합체 를 형성 · 분리 해도 된다 ( 이 단계 에서 , 목적 으로 하 는 DNA 영역 에서 메틸 화 된 DNA 를 포함 하 지 않 는 단일 가닥 DNA 와 본 올리 고 뉴클레오티드 의 결합체 는 , 복합체 를 형성 하 지 않 는다 ) .