나고야 의정서 시행 에 따른 예상 피해액 은 조사 기관 마다 천차만별 이 다 . 환경부 는 지난해 자원 제공 국과 의 이익 공유 비율 을 전체 부가 가치 가운데 최대 3 % 로 가정 할 경우 국내 제약 · 바이오 업계 가 향후 부담 해야 할 비용 이 매년 600 억 ~ 700 억 원 대 라고 추산 했 다 . 한국 환경 정책 평가 연구원 은 국내 바이오 업계 가 나 고 야 의정서 발효 에 따라 매년 136 억 ~ 639 억 원 의 경제 적 부담 을 추가 로 져야 할 것 으로 예측 했 다 . 하지만 산업 계 전체 로 보 면 피해 규모 는 확 늘어난다 . 환경부 가 2011 년 발표 한 ' 나고야 의정서 채택 에 따른 산업 계 파급 효과 및 경쟁력 강화 방안 마련 을 위한 연구 ' 에 따르 면 2014 년 현재 나 고 야 의정서 가 국내 관련 산업 에 미치 는 경제 적 손실 이 3892 억 ~ 5096 억 원 까지 늘어나 는 것 으로 나타났 다 . 하지만 앞 으로 갈수록 유전자원 을 활용 한 연구 와 상업화 가 확대 될 수 밖에 없 다는 점 에서 나 고 야 의정서 에 따른 이익 공유 용 로열티 지급액 이 수조 원 에 달할 수 있 다는 분석 도 적 지 않 다 .