2 개 폴리뉴클레오티드 는 각각 ( 1 ) 2 개 폴리뉴클레오티드 간 의 유사 한 서열 ( 즉 , 완전 한 폴리뉴클레오티드 서열 의 일부분 ) 을 포함 할 수 있 고 , ( 2 ) 2 개 폴리뉴클레오티드 간 의 다른 서열 을 또한 포함 할 수 있 으므로 , " 2 개 ( 또는 이상 의 ) 폴리뉴클레오티드 간 의 서열 비교 는 전형 적 으로 "" 비 교창 "" 에서 2 개 폴리뉴클레오티드 의 서열 을 비교 하 여 서열 유사 성 을 가지 는 국소 영역 을 확인 및 비교 함 으로써 수행 된다 . 본원 에서 사용 된 "" 비 교창 "" 은 적어도 20 개 연속 뉴클레오티드 위치 의 개념 적 세그먼트 를 말 하 며 ", 여기 서 폴리뉴클레오티드 서열 은 적어도 20 개 연속 뉴클레오티드 의 정해진 서열 과 비교 될 수 있 고 , 비 교창 내 의 폴리뉴클레오티드 서열 의 일부분 은 2 개 서열 의 최적 의 정렬 을 위해 정해진 서열 ( 이것 은 추가 또는 결실 을 포함 하 지 않 는다 ) 과 비교 하 여 20 % 이하 의 추가 또는 결실 ( 즉 , 갭 ) 을 포함 할 수 있 다 .