분자 동역학 이 처음 시작 될 즈음 인 1950 년 대 초 만 하 더라도 100 개 정도 의 입자 계 에 대해 100 번 정도 시간 단계 에 걸쳐 시늉 할 때 약 40 시간 의 계산 시간 이 필요 하 였 다 . 이때 계산 할 좌표 의 수 는 104 이 었 다 . 1990 년 대 에 들어서 서 는 수십억 개 의 입자 들 로 된 물리계 를 수백만 번 시간 단계 에 걸쳐 수행 할 수 있 으며 , 1 개월 정도 걸린다 . 이때 , 계산 할 좌표 의 수 는 1015 개 정도 이 다 . 이제 는 중앙 처리 장치 의 속도 뿐 만 아니 라 그 계산 결과 를 표시 하 거나 저장 할 장치 에 있 어서 도 문제 가 된다 . 그 정보 의 양 이 너무 엄청나 서 다루 기 가 쉽 지 는 않 다 . 이 를 효과 적 으로 보여 주 기 위해서 는 문자 정보 보다 는 동영상 이나 가상 현실 로 처리 하 여 눈 으로 직접 쉽 게 확인 할 수 있 도록 그림 으로 보여 주 는 굳 은 모 와 무른 모 가 필요 하 다 .