규칙 적 으로 반복 되 는 짧 은 회문 구조 반복 체 클러스터 및 CRISPR 부속 시스템 ( clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR associated system , CRISPR / Cas 9 ) 은 가장 인기 있 는 게놈 편집 툴 이 다 . 이 시스템 에서 , Cas 9 단백질 은 gRNA 의 안내 하 에 특정 DNA 서열 을 절단 하 여 , 이중 가닥 절단 ( DSB ) 을 형성 한다 . DSB 는 세포 에서 DNA 손상 을 복구 하 기 위해 비 - 상동 적 인 말단 연결 ( NHEJ : non - homologous end joining ) 및 상동 적 인 재조합 ( HR ) 의 세포내 복구 기전 을 활성 화 할 수 있 으며 , 이 로써 복구 과정 중 에 특정 DNA 서열 이 편집 된다 . 현재 , 가장 흔히 사용 되 는 Cas 9 단백질 은 스 트 렙 토코 커스 피 오 게 네스 ( Streptococcus pyogenes ) 유래 의 Cas 9 ( SpCas 9 ) 이 다 . CRISPR / Cas 9 게놈 편집 시스템 의 한 가지 단점 은 특이 성 이 낮 고 오프 - 타 겟 효과 가 있 다는 것 으로 , 이 는 편집 시스템 의 활용 을 상당히 제한 한다 .