이제 분자 동역학 을 위한 기초 지식 에 대해 살펴본다 . 분자 ( molecule ) 는 물질 의 특성 을 주 는 기본 단위 이 다 . 동역학 ( dynamics ) 은 힘 과 물체 의 운동 상태 와 의 관계 를 연구 하 는 것 이 다 . 따라서 분자 동역학 ( molecular dynamics ) 은 한마디 로 이러 한 분자 들 간 의 힘 에 의한 분자 들 의 운동 을 연구 하 여 물질 의 거시 적 성질 을 살펴보 는 것 이 라고 할 수 있 다 . 분자 동역학 에서 는 분자 들 이 변하 거나 깨 어 지 지 않 고 그 자체 로 존재 한다고 가정 한다 .