성공 적 으로 형질 전환 된 유기체 의 선별 은 , 벡터 또는 발현 카세트 에 존재 하 는 마커 유전자 에 의해 착수 될 수 있 다 . 이러 한 마커 유전자 의 예 는 항생제 저항성 에 대한 유전자 , 및 발색 반응 을 촉매 하 여 형질 전환 된 세포 의 착색 을 야기 하 는 효소 에 대한 유전자 이 다 . 이어서 , 이 들 은 자동 세포 분류 에 의해 선별 될 수 있 다 . 벡터 로 성공 적 으로 형질 전환 되 고 , 적절 한 항생제 저항성 유전자 ( 예 를 들 어 , G 418 또는 히 그로 마이신 ) 를 보유 하 는 미생물 은 적절 한 항생제 - 포함 배지 또는 영양 배지 에 의해 선별 될 수 있 다 . 세포 표면 상 에 존재 하 는 마커 단백질 은 친화성 크로마토그래피 에 의해 선별 용 으로 사용 될 수 있 다 .