몇몇 실시 양태 에서 , " 표면 은 별개 의 표면 영역 의 선형 또는 2 - 차원 또는 3 - 차원 ( 및 고체 상 ) 어레이 를 지칭 하 는 "" 마이크로 어레이 "" 의 표면 이 다 . 각 영역 은 ", 예 를 들 면 유리 , 플라스틱 또는 합성 멤 브레인 등 이 있 지만 이 에 한정 되 지 않 는 고체 지 지체 의 표면 상 에 형성 되 어 있 는 정해진 영역 을 갖 는다 . 몇몇 경우 에서 , 각 영역 은 본원 에 기재 된 바 와 같 은 챔버 의 표면 이 다 . 마이크 로 어레이 상 의 별개 의 영역 의 밀도 는 단일 고상 지 지체 의 표면 상 에서 검출 될 고정 된 폴리뉴클레오티드 의 총수 에 의해 결정 될 수 있 으며 , 예 를 들 면 약 50 / cm 2 이상 , 약 100 / cm 2 이상 또는 약 500 / cm 2 이상 , 최대 약 1 , 000 / cm 2 , 또는 이 보다 높 다 . 어레이 는 고정 된 총 폴 리뉴 클레오 티 드 의 약 500 , 약 1 , 000 , 약 1 , 500 , 약 2 , 000 , 약 2 , 500 또는 약 3 , 000 개 미만 의 영역 을 함유 할 수 있 다 . 어레이 에서 각 특정 그룹 의 프로브 의 위치 가 공지 되 어 있 기 때문 에 , 샘플 폴리뉴클레오티드 의 동일 성 은 그 가 마이크 로 어레이 에서 특정 위치 에 결합 하 는 것 을 기초 로 하 여 결정 할 수 있 다 . 마이크 로 어레이 의 사용 에 대한 대안 으로서 , 임의 의 크기 의 어레이 가 본 발명 을 실시 하 는데 있 어서 사용 될 수 있 다 .