특정 구 현예 에서 , 기준 DNA 는 분석 할 샘플 DNA 의 특징 적 인 특성 에 대해 특정 화 되 어 있 다 . 예컨대 , 샘플 DNA 를 특정 유전자좌 또는 염색체 좌 의 이 배수성 ( duplication ) 을 검출 하 기 위해 분석 할 예정 인 경우 , 기준 DNA 에 포함 된 카피 의 유전자 또는 유전자좌 갯 수 를 알 수 있 도록 기준 DNA 를 특정 화 한다 . 대 게 , 동일 종 으로부터 유래 된 샘플 및 기준 DNA 가 이용 된다 .