한 번 의 SVM 실험 을 위해 4000 개 의 단백질 쌍 을 사용 한다 . 훈련 ( training ) 데이터 집합 의 긍정 예제 와 부정 예제 로 각 1000 개 씩 , 실험 ( testing ) 데이터 집합 의 긍정 예제 와 부정 예제 로 각 1000 개 씩 사용 된다 . 즉 , 훈련 데이터 에 사용 된 단백질 쌍 은 같 은 실험 에서 실험 데이터 로 사용 되 지 않 는다 .