Namil ( SA ) - flo 2 와 밀양 23 의 전체 게놈 은 Illumina HiSeq 2500 시퀀싱 시스템 플랫 폼 ( Illumina Inc . USA ) 을 사용 하 여 평균 75 배 의 커버리지 로 재신 퀀싱 되 었 다 . 로우 ( raw ) 서열 리드 ( read ) 를 벼 표준 유전체 ( IRGSP 1 . 0 ) 에 대해 정렬 하 였 다 ( Kawahara et al . , 2013 ) . 분질 배유 관련 유전자 지도 를 작성 하 기 위해서 결 측 값 ( missing value ) 없 는 SNP , 대립 유전자 형 빈도 ( MAF : minor allele frequency ) > 0 . 05 , 두 부모 서열 에 대한 유전자 형 콜 ( genotype call ) 이 사용 되 었 다 . 표적 부위 를 좁히 기 위해서 , Oligo 7 . 0 소프트웨어 를 이용 해 SNP 를 선택 하 여 , 8 개 의 절단 증폭 된 다형 서열 ( CAPS : amplified polymorphic sequence ) 마커 를 개발 하 였 다 .