일부 실시 형태 에서 , 폴리 뉴클레오타이드 는 RNA 중합효소 에 의해 인식 될 수 있 는 전사 개시 부위 하류 의 적어도 하나 의 치환 및 / 또는 삽입 을 포함 할 수 있 다 . 비 제한 적 예 로서 , 적어도 하나 의 치환 및 / 또는 삽입 은 전사 개시 부위 바로 하류 의 영역 ( 예컨대 , 이하 로 제한 되 는 것 은 아니 지만 , + 1 내지 + 6 ) 에서 적어도 하나 의 핵산 을 치환 함 으로써 전사 개시 부위 하류 에서 생길 수 있 다 . 전사 개시 부위 바로 하류 의 뉴클레오타이드 의 영역 에 대한 변화 는 개시 속도 에 영향 을 미칠 수 있 고 , 겉보기 뉴클레오타이드 트라이 포스 페이트 ( NTP ) 반응 상수 값 을 증가 시키 며 , 전사 개시 동안 전사 복합체 로부터 짧 은 전사체 의 해리 를 증가 시킨다 ( Brieba et al , Biochemistry ( 2002 ) 41 : 5144 - 5149 ; 본 명세서 에 전문 이 참고 로 편입 됨 ) . 적어도 하나 의 뉴클레오사이드 의 변형 , 치환 및 / 또는 삽입 은 서열 의 침묵 돌연변이 를 야기 할 수 있 거나 또는 아미노산 서열 에서 돌연변이 를 야기 할 수 있 다 .