전술 한 바 와 같이 , 각각 의 입자 세트 는 , 제 2 증폭 반응 의 산물 이 며 합하 여 실질 적 으로 제 1 증폭 반응 에서 주형 으로 사용 되 는 전체 게놈 DNA 서열 을 나타내 는 , 앰 플리 콘 들 이 결합 된 인코딩 입자 들 을 포함 한다 . 합하 여 , 실질 적 으로 제 1 증폭 반응 에서 주형 으로서 사용 되 는 전체 게놈 DNA 서열 을 나타내 기에 충분 한 , 앰 플리 콘 들 을 포함 하 는 입자 의 수 는 , 주형 의 크기 , 앰 플리 콘 의 크기 , 입자 상 에 앰 플리 콘 결합 에 이용 가능 한 결합 부 의 수 등 의 다수 의 인자 들 에 의해 결정 된다 . 통상 , 함께 제 1 증폭 반응 에 주형 으로서 사용 되 는 전체 게놈 DNA 서열 을 실질 적 으로 나타내 기에 충분 한 입자 의 수 는 포괄 적 으로 약 1 - 10 , 000 개 이 다 .