다음 은 자유 롭 게 다운로드 하 여 사용 할 수 있 는 좌표 , 포스 필드 및 토폴로지 파일 입니다 . 좌표 파일 은 . pdb 형식 으로 되 어 있 으며 대부분 의 분자 그래픽 프로그램 으로 시각 화 할 수 있 습니다 . 포스 필드 및 토폴로지 파일 은 아마도 분자 역학 프로그램 의 Gromacs 세트 와 함께 유용 할 수 있 습니다 . 이러 한 파일 의 대부분 은 게시 된 작품 에서 온 , 하지만 당신 은 당신 의 자신 의 작품 에서 그 들 중 일부 를 사용 하 려는 경우 , 두 번 하 고 트리플 확인 . 나 는 그 들 이 오류 가 없 다는 것 을 보장 하 지 않 습니다 , 그 들 은 불길 에 파열 컴퓨터 와 실험실 을 태워 원인 이 되 는 경우 , 나 를 비난 하 지 않 습니다 . 당신 이 어떤 오류 를 발견 하 면 , 알려 주 시 기 바랍니다 . 이러 한 구조 를 기반 으로 작업 을 게시 하 는 경우 해당 참조 ( 숫자 는 내 발행 물 목록 의 숫자 를 참조 ) 를 인용 하 십시오 . 파일 을 다운로드 하 면 파일 을 사용 하 여 무엇 을 할 계획 인지 듣 고 싶 습니다 . 그게 전부 입니다 : ) PDB 에 는 또한 “ 증착 ” 이 라는 섹션 이 있 으며 , 구조 예금 옵션 이 내장 되 어 있 습니다 . 
 여기 서 는 거대 분자 데이터 ( 폴리 펩티드 , 폴리 뉴클레오티드 및 다당류 의 전자 현미경 / x 선 / NMR 데이터 ) 를 업로드 할 수 있 습니다 . 업로드 된 파일 은 게 시자 정책 에 따라 유효 성 을 검사 하 고 릴리스 됩니다 . “ 도구 ” 옵션 에서 PDB ID 를 입력 하 여 PDB , mmCIF , PDBXL / XML 형식 , 구조 인자 , NMR 구속 조건 및 생물학 적 어셈블리 중 어느 하나 에서 든 단백질 거대 분자 의 직접 다운로드 가 가능 합니다 . 도구 옵션 에 는 쌍 순서 열 또는 구조 정렬 을 계산 하 는 “ RCBS PDB 단백질 비교 도구 ” 와 웹 개발자 를 위한 “ RCBS PDB 위젯 ” 도 있 습니다 . * 참고 : 압축 되 지 않 은 단일 FASTA 파일 은 구조 요약 페이지 에서 다운로드 할 수 있 습니다 . 또한 RCSB PDB 는 ftp 사이트 에서 데이터 를 자동 으로 다운로드 하 는 데 도움 이 되 는 몇 가지 예제 스크립트 를 제공 합니다 . 웹 사이트 는 저자 , 거대 분자 , 서열 및 리간드 에 의해 제한 될 수 있 는 다양 한 검색 옵션 을 기반 으로 3 - D 단백질 구조 를 쉽 게 검색 할 수 있 습니다 . 모든 범주 의 검색 옵션 은 분자 이름 , 구조 영역 및 온톨로지 용어 에 따라 정보 를 제공 합니다 . 선택 된 필수 파일 에 는 3 - D 구조 및 인용 을 결정 하 는 데 사용 되 는 PDB 식별 번호 및 방출 날짜 , 저자 이름 , 단백질 분류 및 계측기 와 함께 있 는 거대 분자 이름 이 있 습니다 . 
 선택 / 검색 된 거대 분자 는 다운로드 ( 다운로드 PDB 파일 ) , 볼 수 ( PDB 파일 보 기 ) 및 3 D 파일 로 볼 수 있 습니다 ( Jmol 와 3 - D 에서 보 기 ) . 데이터베이스 에서 생 성 된 파일 형식 은 처음 에 메 쉬 랩 , Jmol , QuteMol , ACD / ChemSketch 프리웨어 및 키메라 , MDL Chime , Pymol , 스위스 - PDB 뷰어 등 과 같 은 라이센스 소프트웨어 와 같 은 오픈 소스 컴퓨터 프로그램 중 하나 를 사용 하 여 볼 수 있 는 PDB 형식 으로 처음 이 었 다 . 2000 년 말 , PDB 는 PDB 교환 사전 과 PDB 아카이브 데이터 파일 을 PDBML 이 라는 XML 형식 으로 출시 했 습니다 . [ 3 ] PDB 항목 페이지 에서 사용 할 수 있 는 여러 가지 다운로드 옵션 및 파일 형식 이 있 습니다 ( 그림 35 ) . 그림 35 빨간색 상자 는 PDB 항목 의 첫 페이지 에서 사용 할 수 있 는 모든 데이터 다운로드 옵션 을 강조 표시 됩니다 .