Pass - only 변이 는 분석 에 만 사용 하 였 다 . 종양 RNA 염기 서열 분석 ( RNA - Seq ) 데이터 를 미 가공 형태 와 표준 화 된 단백질 암호 화 유전자 의 읽 기 카운트 매트릭스 의 형태 로 Synapse ( https : / / www . synapse . org / #! Synapse : syn 3104297 ) 에서 다운로드 하 였 다 . 읽 기 정렬 은 TopHat 2 를 이용 하 였 고 , HTSeq framework version 0 . 61 p 1 의 htseq - count script 를 이용 해 GENCODE release 19 의 reference General Transfer Format 으로 계산 하 였 고 , FPKM - UQ 표준 화 기법 을 이용 해 표준 화 하 였 다 . PCAWG 위키 웹 페이지 ( https : / / wiki . oicr . on . ca / pages / ) 로부터 임상 , 조직학 적 주석 시트 version 9 ( 각각 2016 년 11 월 22 일 , 2017 년 8 월 21 일 에 생성 ) 를 다운로드 하 였 다 .