구조 는 분자 작동 환경 소프트웨어 ( molecular operating environment ( MOE ) software ) 의 sdwash tool 을 사용 하 여 정리 되 었 다 ( Molecular Operating Environment ( MOE ) , 2013 . 08 ; Chemical Computing Group ULC , 1010 Sherbooke St . West , Suite # 910 , Montreal , QC , Canada , H 3 A 2 R 7 , 2017 ) . 즉 , 연결 되 지 않 은 염 분자 ( salt molecule ) 와 무기 금속 이온 이 구조 에서 제거 되 었 다 . 반응 성 그룹 을 지닌 리간드 를 제거 하 고 , 부서진 리간드 의 가장 큰 단편 을 라이브러리 에 보관 하 였 다 . 명시 적 인 수소 원자 가 추가 되 었 고 , pH 7 . 0 에서 양성자 화 상태 가 조정 되 었 다 . 각 리간드 에 대해 최대 10 개 의 토토 머 상태 ( tautomeric states ) 가 열거 되 었 고 , 분자 내 결합 이 적당 한 길이 로 조정 되 었 다 . 그 후 , 화학 적 라이브러리 는 0 . 1 의 root mean square gradient 에 도달 할 때 까지 MMFF 94 x force field 를 사용 하 여 에너지 를 최소 화 하 였 다 . 에너지 를 최소 화 하 기 전 에 리간드 의 부분 전하 를 MMFF 94 x force field 를 이용 하 여 계산 하 였 다 .