일반 적 으로 , Cas 9 단백질 과 같 은 Cas 단백질 은 2 개 의 뉴클레아제 도메인 을 포함 한다 . 예 를 들 어 , Cas 9 단백질 은 RuvC - 유사 뉴클레아제 도메인 및 HNH - 유사 뉴클레아제 도메인 을 포함 할 수 있 다 . RuvC 및 HNH 도메인 은 단일 스트랜드 를 절단 하 여 DNA 에서 이중 스트랜드 를 만들 기 위해 함께 작동 한다 . ( Jinek et al . , Science , 337 : 816 - 821 ) . 정상 적 으로 DSB 를 도입 할 수 있 는 이러 한 Cas 단백질 은 하나 의 기능 성 뉴클레아제 도메인 ( 예 를 들 어 , RuvC - 유사 또는 HNH - 유사 뉴클레아제 도메인 ) 만 을 함유 하 거나 , 또는 기능 성 뉴클레아제 도메인 을 함유 하 지 않 도록 변형 될 수 있 다 . 뉴클레아제 도메인 은 하나 이상 의 뉴클레아제 도메인 이 더 이상 기능 하 지 않 도록 ( 즉 , 뉴클레아제 활성 이 없 음 ) 변이 되 어 , CRISPR 니카 아제 를 생성 하 는 Cas 단백질 의 변이체 이거 나 변이체 일 수 있 다 . 예 는 D 10 A ( 예 를 들 어 , Cong 등 ( Science ( 2013 ) ; 339 ( 6121 ) : 819 - 23 ) 에 의해 기술 된 바 와 같 은 ) 또는 H 840 A 와 같 은 돌연변이 를 갖 는 SpCas 9 변이체 이 다 . 이러 한 CRISPR 니카 아 제 는 따라서 이 중 스트랜드 핵산 내 로 닉 을 도입 할 수 있 지만 , 이 중 스트랜드 DNA 를 절단 할 수 는 없 다 . 두 도메인 모두 가 더 이상 기능 하 지 않 도록 돌연변이 된 경우 , dCas 결과물 이 다 . 예 는 돌연변이 D 10 A 및 H 840 A 를 모두 갖 는 SpCas 9 변이체 이 다 . 이러 한 dCas 는 이중 스트랜드 핵산 에 바인딩 할 수 있 지만 , 스트랜드 중 하나 를 절단 하 지 는 않 는다 . CRISPR 니카 아제 및 dCas 는 당업자 에게 공지 되 어 있 으며 , 이 의 예 는 본원 의 다른 곳 에서 제공 된다 . CRISPR - 뉴클레아제 의 뉴클레아제 도메인 중 하나 또는 둘 모두 는 공지 된 방법 , 예컨대 부위 - 지정 돌연변이 유발 , PCR - 매개 돌연변이 유발 , 및 총 유전자 합성 , 뿐 만 아니 라 당업 계 에 알려진 다른 방법 을 이용 하 여 활성 되 는 것 과 같이 변형 될 수 있 다 .