NGS 시퀀싱 데이터 QC 및 변이체 분석 . 디폴트 매개변수 를 사용 하 여 , Illumina MiSeq 분석 소프트웨어 ( MiSeq 리포터 , 버전 2 . 6 . 2 , Illumina ) 를 사용 하 여 , 앰 플리 콘 특이 적 FASTQ 시퀀싱 데이터 파일 을 발생 시켰 다 ( Cock et al , Nucleic Acids Res . 2010 , 38 ( 6 ) : 1767 - 71 , PMID : 20015970 ) . 그 후 에 , FASTQ 파일 을 , 표준 Perl 스크립트 랩퍼 ( script wrapper ) 를 사용 하 여 함께 접합 된 일련 의 공개 도메인 소프트웨어 패키지 로 구성 된 내부 적 으로 개발 된 변이체 분석 파이프라인 을 통해 처리 하 였 다 . 사용 된 작업 흐름 을 5 개 단계 로 나누 었 다 .