당시 농림 수산 식품 부 등 의 수사 의뢰 를 받 은 검찰 은 2009 년 6 월 PD 수첩 제작진 5 명 을 명예 훼손 · 업무 방해 혐의 로 불 구속 기소 했 지만 2011 년 9 월 무죄 가 확정 됐 다 . 대법원 은 ' 보도 내용 중 허위 사실 이 있 지만 공공 성 을 근거 로 했 기 때문 에 명예훼손 책임 을 물 을 수 는 없 다 ' 고 판단 했 다 . 일부 에선 ' 검찰 이 제작진 을 무리 하 게 기소 해 언론 자유 를 탄압 했 다 ' 며 여론 을 호도 했 다 .