보존 된 ( conserved ) 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 의 서열 상동성 또는 동일 성 은 표준 배열 알고리즘 에 의해 결정 되 며 , 사용 되 는 프로그램 에 의해 확립 된 디폴트 갭 페널티가 함께 이용 될 수 있 다 . 실질 적 으로 , 상동성 을 갖 거나 ( homologous ) 또는 동일 한 ( identical ) 서열 은 중간 또는 높 은 엄격 한 조건 ( stringent conditions ) 에서 일반 적 으로 서열 전체 또는 전체 - 길이 의 적어도 약 50 %, 60 %, 70 %, 80 % 또는 90 % 이상 으로 하이브리드 할 수 있 다 . 하이브리드 화 는 폴리뉴클레오티드 에서 코돈 대신 축퇴 코돈 을 함유 하 는 폴리뉴클레오티드 또한 고려 된다 .