히스톤 스템 - 루프 서열 을 규정 하 기 위하 여 , 후생동물 및 원생동물 로부터 ( 4001 sequences ) , 또는 원생동물 로부터 ( 131 서열 ) 또는 그 대신 후생동물 로부터 ( 3870 서열 ) , 또는 척추 동물 로부터 ( 1333 서열 ) 또는 인간 으로부터 ( 84 서열 ) 유래 한 서열 들 을 그룹 화 하 고 정렬 하 였 다 . 그 다음 , 존재 하 는 뉴클레오티드 의 양 은 모든 위치 를 위해 측정 되 었 다 . 이 와 같이 획득 한 표 에 근거 하 여 , 서열 들 의 5 가지 다른 그룹 의 공통 서열 들 이 만들 어 졌 고 , 이 들 은 분석 된 서열 들 에 나타나 는 모든 뉴클레오티드 를 대표 한다 . 조합 된 후생동물 및 원생동물 의 공통 서열 내 에서 , 염기쌍 을 형성 하 는 , 3 뉴클레오티드 들 , 루프 내 의 T / U , 그리고 스템 내 의 G 와 C 은 보존 되 었 다 . 구조 적 으로 , 6 염기 - 쌍 스템 및 4 뉴클레오티드 루프 가 만들 어 지 는 것 이 일반 적 이 다 . 그러나 , 변형 된 구조 들 이 일반 적 이 다 : 84 사람 히스톤 스템 - 루프 의 , 둘 은 4 4 염기 - 쌍 및 하나 의 미스 매치 를 포함 하 는 오직 5 뉴클레오티드 의 스템 을 포함 한다 . 다른 사람 히스톤 스템 - 루프 는 오직 5 염기 - 쌍 의 스템 을 포함 한다 . 4 개 의 더 많 은 사람 히스톤 스템 - 루프 는 6 뉴클레오티드 길 이 스템 을 포함 하 지만 , 각각 , 세계 의 다른 위치 에서 , 하나 의 미스 매치 를 포함 한다 . 게다가 , 네 개 의 사람 히스톤 스템 - 루프 는 각각 , 두 개 의 다른 위치 들 에서 하나 의 워 블 염기 - 쌍 을 포함 한다 . 루프 에 관해서 는 , 5 뉴클레오티드 의 루프 가 D . discoideum 에서 발견 되 어 진 것 처럼 , 4 뉴클레오티드 의 길이 가 엄격 하 게 요구 되 는 것 처럼 보이 지 않 는다 .