도 4 c 에 제시 된 예 는 디 뉴클레오티드 3 '- 오버행 을 가진 두 21 개 의 뉴클레오티드 서열 의 19 개 의 염기쌍 이중체 를 포함 하 는 본 발명 의 모델 이중 가닥 핵산 분자 를 나타낸다 . 상부 가닥 ( 1 ) 은 센스 가닥 ( 패 신저 가닥 ) 을 나타내 고 , 중간 가닥 ( 2 ) 은 안티 센스 가닥 ( 가이드 가닥 ) 을 나타내 고 , 하부 가닥 ( 3 ) 은 표적 폴리뉴클레오티드 서열 을 나타낸다 . 디 뉴클레오티드 오버행 ( NN ) 은 표적 폴리뉴클레오티드 로부터 유래 된 서열 을 포함 할 수 있 다 . 예 를 들 어 , 가이드 가닥 중 의 3 '-( NN ) 서열 은 표적 폴리뉴클레오티드 의 5 '-[ NN ] 서열 에 상보 적 일 수 있 다 . 추가 로 , 패 신저 가닥 의 5 '-( NN ) 서열 은 표적 폴리뉴클레오티드 서열 의 5 '-[ NN ] 서열 과 동일 한 서열 을 포함 할 수 있 다 . 다른 실시 양태 에서 , 오버행 ( NN ) 은 표적 폴리뉴클레오티드 서열 로부터 유래 하 지 않 으며 , 예 를 들 어 , 가이드 가닥 중 의 3 '-( NN ) 서열 이 표적 폴리뉴클레오티드 의 5 '-[ NN ] 서열 에 상보 적 이 지 않 고 , 패 신저 가닥 의 5 '-( NN ) 서열 이 표적 폴리뉴클레오티드 서열 의 5 '-[ NN ] 서열 과 상이 한 서열 을 포함 할 수 있 다 . 추가 의 실시 양태 에서 , 임의 의 ( NN ) 뉴클레오티드 는 , 예컨대 , 2 '- O - 메틸 , 2 '- 데 옥시 - 2 '- 플 루 오로 및 / 또는 본원 의 다른 변형 과 같이 화학 적 으로 변형 된다 . 추가 로 , 패 신저 가닥 은 패 신저 가닥 의 리보 뉴클레오티드 위치 N 을 포함 할 수 있 다 . 제시 된 대표 적 인 19 개 의 염기쌍 21 량 체 이중체 의 경우 , 위치 N 은 패 신저 가닥 의 3 ' 말단 으로부터 9 개 뉴클레오티드 일 수 있 다 . 그러나 , 상이 한 길이 의 이중체 에서 , 위치 N 은 가이드 가닥 의 5 ' 말단 으로부터 11 개 의 뉴클레오티드 위치 의 수 를 계수 하 여 패 신 저 가닥 중 의 상응 하 는 염기쌍 이 형성 된 뉴클레오티드 를 선택 함 으로써 가이드 가닥 의 5 ' 말단 을 기준 으로 결정 된다 . Ago 2 에 의한 절단 은 화살표 로 표시 된 , 10 번 위치 와 11 번 위치 사이 에서 일어난다 . 추가 의 실시 양태 에서 , 2 개 의 리보 뉴클레오티드 NN 은 , 가이드 가닥 의 5 ' 말단 으로부터 10 및 11 개 의 뉴클레오티드 위치 의 수 를 계수 하 여 패 신 저 가닥 중 의 상응 하 는 염기쌍 이 형성 된 뉴클레오티드 를 선택 함 으로써 가이드 가닥 의 5 ' 말단 을 기준 으로 10 번 위치 와 11 번 위치 에 존재 한다 .