이후 이 영화 는 , 조엘 과 클레멘타인 의 만남 이 처음 이 아니 었 음 을 우리 에게 알리 고 , 그 들 이 왜 처음 본 것 처럼 행동 하 고 , 또 왜 그리 쉽 게 가까워졌 는지 를 말 해 준다 . 영화 는 하루하루 가장 최근 의 시간 부터 거꾸로 거슬러 올라간다 . 클레멘타인 이 자신 을 기억 속 에서 지웠 음 을 알 아 버린 그날 , 조엘 은 자신 도 그녀 를 지우 기 위해 그녀 가 했 던 것 처럼 그대로 라 쿠나 주식회사 의 미 웨 즈윅 박사 를 찾아간다 . 자신 과 의 추억 을 그렇게 장난 스럽 고 충동 적 으로 지운 그녀 에 대한 분노 가 더해져 조 엘 역시 자신 의 기억 을 지우 기 위해 그녀 의 기억 이 조금 이 라도 묻 어 있 는 물건 들 을 싸 들 고 다시 라 쿠나 로 향한다 . 그날 밤 , 자신 의 방 안 에서 잠든 그 에게 라 쿠나 직원 스탠 과 패트릭 , 그리고 매리 가 그 의 머릿속 에서 클레멘타인 을 지우 기 시작 한다 . 가장 최근 의 기억 부터 지우 는 그 들 은 조엘 과 클레멘타인 의 마지막 날 부터 거슬러 올라가 지만 , 클레멘타인 의 기억 을 지우 다 그녀 에게 빠져버린 패트릭 이 그녀 에 대한 이야기 를 조엘 의 기억 밖 에서 스탠 과 나누 는 도중 조엘 은 자신 의 기억 안 에서 서서히 혼선 을 겪 기 시작 한다 . 현실 의 클레멘타인 이 조엘 의 머릿속 에서 자신 이 지워짐 과 동시 에 불안 을 느끼 기 시작 하 고 , 조엘 을 따라 하 면서 그녀 에게 접근 한 패트릭 의 말 들 이 기억 속 의 조엘 에게 혼란 을 가중 시킨다 . 그리고 결국 기억 삭제 를 원치 않 게 된 그 는 자신 의 기억 을 지우 려는 스탠 과 미어 즈 웩 박사 와 숨바꼭질 을 시작 한다 .