상기 PSI - BLAST 는 단백질 - 단백질 서열 유사 성 검색 방법 에 의해 임계 값 이상 의 점수 를 갖 는 서열 의 다중 서열 정렬 ( MSA ) 로부터 PSSM ( position - specific scoring matrix ) 을 생성 한다 ( 도 2 ) . PSSM 은 반복 검색 을 통해 높 은 점수 ( 즉 , 높 은 유사성 ) 를 갖 는 서열 을 발견 하 고 결과 적 으로 단백질 간 의 먼 관계 를 검출 할 수 있 다 . 본 발명 의 tK 562 의 경우 이 의 전체 서열 에 대하 여 높 은 상동 성 을 갖 는 단백질 이 존재 하 지 않 아 서열 의 일부분 과 높 은 상동 성 을 갖 는 단백질 들 을 선택 하 였 다 . 다중 서열 정렬 은 서열 데이터 의 간결 하 고 유익 한 요약 을 생성 하 고 , 결과 로부터 상동 성 을 추론 하 고 , 서열 간 의 진화 관계 를 검증 하 기 위해 유사 한 길이 의 세 개 이상 의 서열 을 정렬 한다 .