분리 된 상기 총 RNA 의 질 과 양 이 우수 한 것 을 확인 하 고 , 상기 RNA 를 주형 으로 하 고 올리 고 dT 를 프라이머 로 하 여 역전사 반응 을 시켜 , cDNA 를 얻 었 다 . 얻 어 진 cDNA 는 인 비트 로 전사 반응 을 통해 cRNA 를 합성 하 는 주형 으로 사용 되 는 데 이때 비 오 틴 으로 변형 된 UTP 를 반응 액 에 첨가 함 으로써 합성 된 cRNA 는 비오틴 으로 표지 가 되 었 다 . 다음 으로 , 상기 합성 된 비오틴 표지 된 cRNA 를 히드록시 라디칼 과 반응 시켜 50 내지 200 bp 크기 로 단편 화 하 였 다 . 상기 단편 화 된 cRNA 시료 10 ㎍ 을 Affymetrix GeneChip array ( 인간 133 plus ver 2 ) 상 에 주입 하 고 45 ℃ 에서 16 시간 동안 혼성 화 반응 을 시켰 다 . 다음 으로 , 세척 하 고 , 피코 에 리쓰린 ( phycoerythrin : PE ) 으로 표지 된 스 트 렙 타 비딘 으로 혼성 화 된 비오틴 을 염색 하 였 는데 , 이때 신호 를 증폭 하 기 위하 여 비오틴 화 된 항 - 스 트 렙 타비 딘 항체 를 첨가 하 여 염색 하 였 다 . 염색 된 마이크 로 어레이 표면 을 532 nm 파장 의 빛 으로 조사 하 고 570 nm 파장 의 형광 을 검출 하 여 형광 강도 를 측정 하 였 다 .