면역원 성 의 고려 는 백신 에 포함 을 위한 최적 의 네오 에 피토프 의 선택 에서 중요 한 성분 이 다 . 면역원 성 은 , 예 를 들 어 , 네오 에 피토프 의 MHC 결합 능력 , HLA 난잡 , 돌연변이 위치 , 예측 된 T 세포 반응 성 , 실제 T 세포 반응 성 , 특정 입체 배좌 를 야기 하 는 구조 및 얻 어 진 용매 노출 및 특정 아미노산 의 제시 를 분석 함 으로써 평가 될 수 있 다 . 공지 된 알고리즘 , 예컨대 NetMHC 예측 알고리즘 은 공통 HLA - A 및 - B 대립 유전자 에 결합 하 는 펩타이드 의 능력 을 예측 하 는 데 사용 될 수 있 다 . MHC 결합 펩타이드 의 구조 적 평가 는 또한 인 실리 코 3 - 차원 분석 및 / 또는 단백질 도킹 프로그램 에 의해 수행 될 수 있 다 . 로 세타 ( Rosetta ) 알고리즘 으로부터 획득 된 것 과 같 은 MHC 분자 에 결합 될 때 예측 된 에 피토프 의 사용 은 에 피토프 가 MHC 분자 에 결합 될 때 에 피토프 의 아미노산 잔기 의 용매 노출 정도 를 평가 하 는 데 사용 될 수 있 다 . T 세포 반응 성 은 시험 관내 에 피토프 및 T 세포 를 이용 하 는 실험 에 의해 평가 될 수 있 다 . 대안 적 으로 T 세포 반응 성 은 T 세포 반응 / 서열 데이터 세트 를 이용 하 여 평가 될 수 있 다 .