항체 의 선호 하 는 장소 에 돌연변이 를 발생 시키 기 위하 여 특정 잔기 나 부분 을 파악 하 는데 유용 한 방법 은 커닝햄 ( Cunningham ) 과 웰스 ( Wells ) ( 1989 ) 사이언스 ( Science ) , " 244 : 1081 - 1085 에서 기술 한 "" 알라닌 ( alanine ) 스캐닝 ( scanning ) 돌연변이 발생 "" 이 다 . 여기 에서 ", 목표 로 하 는 잔기 나 잔기 의 군집 을 파악 ( 즉 알 지닌 , 아스파라진 , 히스티딘 , 라이신 , 글루타민 과 같 은 대전 한 잔기 ) 하 고 중성 또는 음성 으로 대전 한 아미노산 ( 가장 알맞 은 것 은 알라닌 ( alanine ) 이나 폴리 알라닌 ( polyalanine ) ) 으로 교체 하 여 항원 과 아미노산 의 상호 작용 에 영향 을 준다 . 이러 한 치환 에 기능 적 인 민감 성 을 나타내 는 아미노산 의 위치 를 치환 한 장소 에 추가 로 또는 다른 변종 을 집어넣 어서 더 세밀 하 게 다듬 는다 . 그러므로 아미노산 서열 변종 을 만들 기 위한 장소 는 미리 결정 하 지만 , 돌연변이 의 성질 은 본질 적 으로 미리 결정 할 필요 는 없 다 . 일례 로 , 어떤 주어진 장소 에 대한 돌연변이 의 효과 를 분석 하 기 위하 여 알라닌 스캐닝 또는 무작위 돌연변이 생성 을 목표 코돈 이나 부위 에 수행 하 고 , 발현 한 면역 글로불린 을 원하 는 활성 이 있 는지 스크리닝 한다 .