또 다른 실시 형태 에서 , 불활성 Cas 9 분자 는 염색질 을 변형 하 는 단백질 과 융합 될 수 있 다 . 예 를 들 어 불활성 Cas 9 분자 는 이질 염색질 단백질 1 ( HP 1 ) , 히스톤 리신 메틸 트랜스퍼 라 제 ( 예 를 들 어 SUV 39 H 1 , SUV 39 H 2 , G 9 A , ESET / SETDB 1 , Pr - SET 7 / 8 , SUV 4 - 20 H 1 , RIZ 1 ) , 히스톤 리신 데메 틸 레이트 ( 예 를 들 어 LSD 1 / BHC 1 10 , SpLsd 1 / Sw , 1 / Saf 1 10 , Su ( var ) 3 - 3 , JMJD 2 A / JHDM 3 A , JMJD 2 B , JMJD 2 C / GASC 1 , JMJD 2 D , Rph 1 , JARID 1 A / RBP 2 , JAR 1 D 1 B / PLU - 1 , JAR 1 D 1 C / SMCX , JARID 1 D / SMCY , Lid , Jhn 2 , Jmj 2 ) , 히스톤 리신 데 아세틸 라 제 ( 예 를 들 어 HDAC 1 , HDAC 2 , HDAC 3 , HDAC 8 , Rpd 3 , Hos 1 , Cir 6 , HDAC 4 , HDAC 5 , HDAC 7 , HDAC 9 , Hda 1 , Cir 3 , SIRT 1 , SIRT 2 , Sir 2 , Hst 1 , Hst 2 , Hst 3 , Hst 4 , HDAC 11 ) 및 DNA 메틸 라 제 ( DNMT 1 , DNMT 2 a / DMNT 3 b , MET 1 ) 에 융합 될 수 있 다 . 불활성 Cas 9 - 염색질 변형 분자 융합 단백질 은 표적 유전자 의 발현 을 감소 시키 기 위해 염색질 상태 를 변경 하 는 데 사용 될 수 있 다 .