tracr 는 뉴클레아제 ( 예 를 들 어 Cas 9 ) 결합 에 필요 한 핵산 서열 이 다 . 임의 의 이론 으로 결부 시키 고자 하 는 것 은 아니 지만 , 각각 의 Cas 9 종 은 특정 tracr 서열 과 관련 되 어 있 다고 여겨진다 . Tracr 서열 은 sgRNA 및 dgRNA 시스템 둘 모두 에 이용 된다 . 실시 형태 에서 , tracr 는 S . 피 오 게 네스 tracr 로부터 의 서열 , 또는 이 로부터 유래 된 서열 을 포함 한다 . 일부 양태 에서 , tracr 는 crRNA 의 플래그 폴 부분 에 혼성 화 되 는 일부분 을 가지 며 , 예 를 들 어 적어도 일부 생리 적 조건 하 에서 이중 영역 을 형성 하 기 에 충분 한 crRNA 플래그 폴 영역 에 대한 상보성 을 갖 는다 ( 때때로 본원 에서 tracr 플래그 폴 영역 또는 crRNA 플래그 폴 영역 에 상보 적 인 tracr 도메인 으로 지칭 됨 ) . 실시 형태 에서 , crRNA 플래그 폴 영역 과 혼성 화 되 는 tracr 도메인 은 crRNA 플래그 폴 영역 의 상보 적 인 뉴클레오타이드 와 혼성 화 되 는 적어도 5 , 6 , 7 , 8 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 또는 20 개 뉴클레오타이드 를 포함 한다 . 일부 양태 에서 , crRNA 플래그 폴 영역 의 상보 적 인 뉴클레오타이드 와 혼성 화 되 는 tracr 뉴클레오타이드 는 연속 적 이 다 . 일부 양태 에서 , crRNA 플래그 폴 영역 의 상보 적 인 뉴클레오타이드 와 혼성 화 되 는 tracr 뉴클레오타이드 는 불연속 적 이 고 , 예 를 들 어 crRNA 플래그 폴 영역 의 뉴클레오타이드 와 염기쌍 형성 하 지 않 는 뉴클레오타이드 에 의해 분리 된 2 개 이상 의 혼성 화 영역 을 포함 한다 . 일부 양태 에서 , crRNA 플래그 폴 영역 에 혼성 화 되 는 tracr 의 부분 은 5 ’ 으로부터 3 ’ 까지 UAGCAAGUUAAAA ( SEQ ID NO : 191 ) 를 포함 한다 . 일부 양태 에서 , crRNA 플래그 폴 영역 에 혼성 화 되 는 tracr 부분 은 5 ’ 으로부터 3 ’ 까지 UAGCAAGUUUAAA ( SEQ ID NO : 192 ) 를 포함 한다 . 실시 형태 에서 , crRNA 플래그 폴 영역 과 혼성 화 되 는 서열 은 tracr 상 에서 뉴클레아제 , 예 를 들 어 Cas 분자 , 예 를 들 어 Cas 9 분자 와 추가 적 으로 결합 하 는 tracr 의 서열 의 5 ' 에 배치 된다 .