일부 양상 에서 , 본 발명 은 환자 특이 적 인 복잡 한 돌연변이 를 동정 하 고 , 이 들 돌연변이 를 효과 적 인 개인 화 된 mRNA 백신 으로 제형 화 하 는 방법 을 수반 한다 . 상기 방법 은 짧 은 판독 RNA - Seq 의 사용 을 수반 한다 . RNA - seq 에 대해 짧 은 판독 을 이용 하 는 것 에 고유 한 주 된 도전 은 다중 mRNA 전사체 아이 소 폼 이 대안 의 스 플라 이싱 및 다른 메커니즘 에 기인 하 여 동일 한 게놈 좌위 로부터 얻 어 진다는 사실 이 다 . 서열 분석 판독 은 전장 mRNA 전사체 보다 훨씬 더 짧 기 때문 에 , 공지 된 유전자 주석 모델 내 에서 정확 한 대응 하 는 아이 소 폼 에 대해 다시 판독 세트 를 맵 핑 하 는 것 은 어렵 게 된다 . 그 결과 , 공지 된 유전자 주석 ( 암 에서 공통 됨 ) 으로부터 갈라지 는 복잡 한 변이체 는 표준 접근 에 의해 발견 하 는 것 이 어려울 수 있 다 . 그러나 , 본 발명 은 전장 전사체 의 정확 한 엑손 조성물 보다 짧 은 펩타이드 의 동정 을 수반 한다 . 이 들 복잡 한 돌연변이 를 나타낼 짧 은 펩타이드 를 동정 하 는 방법 은 복잡 한 변이체 의 네오 - 에 피토프 예측 에 대한 짧 은 k - 량 체 계수 화 접근 을 수반 한다 .