" 본원 에 식별 된 폴리펩티드 서열 과 관련 하 여 "" 퍼센트 ( %) 아미노산 서열 동일 성 "" 은 서열 을 정렬 하 고 필요 한 경우 최대 퍼센트 서열 동일 성 을 성취 하 기 위해 갭 을 도입 한 후 비교 되 는 폴리펩티드 내 아미노산 잔기 와 동일 한 후보 서열 에서 의 아미노산 잔기 의 % 로서 정의 되 고 서열 동일 성 의 일부 로서 임의 의 보존 성 치환 을 고려 하 지 않 는다 . 퍼센트 아미노산 서열 동일 성 을 결정 하 기 위한 목적 을 위한 정렬 은 ", 예 를 들 어 , 공공연 하 게 이용 가능 한 컴퓨터 소프트웨어 예컨대 BLAST , BLAST - 2 , ALIGN , 또는 Megalign ( DNASTAR ) 소프트웨어 를 사용 하 여 당업 계 의 기술 내 에 있 는 다양 한 방식 으로 달성 될 수 있 다 . 당업자 는 정렬 을 측정 하 기 위하 여 , 비교 되 는 서열 의 전장 에 걸쳐서 최대 정렬 을 달성 하 는 데 필요 한 임의 의 알고리즘 을 포함 하 여 , 적절 한 파라미터 를 결정 할 수 있 다 . 그러나 , 본 명세서 에서 의 목적 을 위해 , % 아미노산 서열 동일 성 값 은 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN - 2 를 사용 하 여 생성 된다 . ALIGN - 2 서열 비교 컴퓨터 프로그램 은 제조사 ( Genentech , Inc . ) 에 의해 개발 되 었 고 , 소스 코드 는 사용 자 기록 문서 와 함께 미국 저작 권 청 , 워싱턴 D . C . , 20559 ( 미국 저작 권 등록 번호 TXU 510087 하 에서 등록 됨 ) 와 같이 제출 되 었 다 . ALIGN - 2 프로그램 은 캘리포니아 주 사우스 샌프란시스코 소재 의 Genentech , Inc . 을 통해 공공연 하 게 이용 가능 하 다 . ALIGN - 2 프로그램 은 UNIX 운영 체제 , 바람직 하 게 는 디지털 UNIX V 4 . 0 D 상 에서 사용 하 기 위해 컴파일 링 되 어야 한다 . 모든 서열 비교 매개변수 는 ALIGN - 2 프로그램 에 의해 설정 되 고 변하 지 않 는다 .