PCR 을 수행 하 고 , 칩 슬라이드 를 세 척하 여 레이저 스캐너 에 의해 스캐닝 하 고 , 결과 를 분석 한다 . 이 과정 은 별도 의 혼성 화 단계 가 필요 하 지 않 으므로 DNA 칩 의 사용 과 관련 된 단계 들 을 단축 시킨다는 점 에서 이상 적 이 다 . 포획 프로브 에 혼성 화 된 형광 표지 된 증폭 된 DNA 를 직접 분석 하 는 것 과 관심 의 대상 인 유전자 서열 을 세포 로부터 직접 PCR 하 는 것 을 조합 하 는 경우 , 이 는 DNA 칩 에 의한 유전자 분석 을 가속 화 할 것 이 다 . 수상돌기 코팅 된 표면 의 사용 또는 포획 프로브 들 사이 에 원하 는 공간 을 유지 하 는 다른 표면 구조 의 사용 , 및 포획 프로브 와 수상돌기 사이 의 열 안정 성 결합 의 사용 또는 다른 구조 의 사용 은 DNA 칩 의 표면 상 의 성공 적 인 PCR 에 대해 적용 하 는 것 이 유리 하 다 . 예 를 들 어 , 한국 특허 제 10 - 0383080 - 0000 호 및 공개 된 미국 특허 출원 제 2005 / 0037413 호 에 개시 된 수상돌기 는 본원 에 기술 된 바 와 같이 사용 하 기 에 적합 하 다 .