플라 젤린 단량체 는 도메인 D 0 내지 D 3 에 의해 형성 된다 . 줄기 세포 를 형성 하 는 D 0 및 D 1 은 직렬 의 긴 알파 나선 으로 구성 되 고 , 상이 한 박테리아 중 에서 고도 로 보존 된다 . D 1 도메인 은 TLR 5 활성 화 에 유용 한 아미노산 의 몇몇 신장 을 포함 한다 . 전체 D 1 도메인 또는 도메인 내 의 활성 영역 중 하나 이상 은 플라 젤린 의 면역원성 단편 이 다 . D 1 도메인 내 의 면역원성 영역 의 예 는 살모넬라 티피 뮤 리 움 FliC 플라 젤린 에서 잔기 88 내지 114 및 잔기 411 내지 431 을 포함 한다 . 88 내지 100 개 의 영역 에서 13 개 의 아미노산 내 에서 , 살모넬라 플라 젤린 과 TLR 5 활성 화 를 여전히 보존 하 는 다른 플라 젤린 사이 에 적어도 6 개 의 치환 이 허용 된다 . 따라서 , 플라 젤린 의 면역원성 단편 은 TLR 5 를 활성 화 하 고 FliC 의 88 내지 100 에서 살모넬라 서열 ( LQRVRELAVQSAN ; 서열 번호 356 ) 에 대해 53 % 이상 동일 한 13 개 의 아미노산 모티프 를 함유 하 는 플라 젤린 유사 서열 을 포함 한다 .