신규 약제 의 스크리닝 방법 은 대표 적 으로 세 가지 를 들 수 있 다 : 첫째 , 질병 의 발현 메카 니즘 에 결정 적 인 기여 를 하 는 효소 나 수용체 들 의 활성 에 대한 후보 약물 의 영향 을 직접 관측 함 으로써 후보 약물 을 검색 하 는 단백질 ( 또는 분자 ) 기반 방법 ( protein - based method or molecule - based method ) ; 둘째 , 생명체 개체 의 형학 적 또는 생화학 적 특성 에 미치 는 후보 약물 의 영향 을 관측 함 으로써 후보 약물 을 검색 하 는 개체 기반 방법 ( organism - based method ) ; 마지막 으로 , 세포 나 세포내 소 기관 의 형태 , 세포내 단백질 의 발현 , 이동 및 대사 등 에 미치 는 후보 약물 의 영향 을 관측 함 으로써 후보 약물 을 검색 하 는 세포 기반 방법 ( cell - based method ) 으로 구분 할 수 있 다 . 단백질 기반 방법 의 경우 , 특이 적 목표 단백질 을 대상 으로 분석 을 수행 할 수 있 다는 장점 이 있 지만 , 시험관 내 ( in vitro ) 에서 수행 되 므로 세포내 의 여러 가지 복합 적 인 요인 들 을 검사 할 수 없 기 때문 에 후보 약물 을 생체 에 적용 하 기 위해서 는 장시간 을 요하 는 많 은 추가 적 인 실험 들 이 필요 하 게 된다 . 그런 반면 , 개체 기반 또는 세포 기반 방법 은 , 개체 수준 또는 세포 수준 에서 후보 약물 에 의해 일어나 는 종합 적 인 변화 를 검출 할 수 는 있 으나 , 후보 약물 의 영향 이 목표 유전자 또는 목표 단백질 에 대해서 특이 적 으로 미친다는 것 을 확인 하 기 위해서 는 , 단백질 기반 의 방법 과 마찬가지 로 장시간 을 요하 는 추가 실험 이 필수 적 이 게 된다 .