이전 에 공지 된 좌표 ( PDB ID , 3 NG 9 ) 를 AAV 1 VP 3 삼 량 체 / 3 - 겹 대칭축 의 3 차원 구조 를 생성 했 다 . AAVrh . 10 과 다양 한 AAV 1 / rh . 10 키메라 캡시드 구조 의 상동성 모델 ( homology model ) 을 AAV 8 VP 3 ( PDB ID , 2 QA 0 ) 의 결정 구조 를 주형 으로 하 여 SWISS - Model 서버 ( swissmodel . expasy . org ) 를 이용 하 여 수득 하 고 , AAV 1 VP 3 ( PDB ID 3 NG 9 ) 단량체 를 주형 으로 하 고 , WinCoot 소프트웨어 중 SSM ( secondary structure matching ) 어플리케이션 을 이용 하 여 구조 - 기반 정렬 을 생성 하 였 다 . VIPERd oligomer generator utility ( viperdb . scripps . edu / oligomer _ multi . php ) 를 이용 하 여 VP 3 삼 량 체 / 3 - 겹 대칭축 , VP 3 삼 량 체 이량체 / 2 - 겹 대칭축 , VP 3 오 량 체 / 5 - 겹 대칭축 , 및 완전 캡시드 ( full capsid ) 를 생성 했 다 . 이 모델 들 의 표면 - 연출 묘사 ( surface rendered depiction ) 를 PyMOL ( the PyMOL Molecular Graphics System , SchrOdinger LLC , www . pymol . org ) 을 이용 하 여 시각 화 시켰 다 . RIVEM ( Radial Interpretation of Viral Electron Density Maps ) 소프트웨어 를 이용 하 여 AAVrh . 10 - 유래 신경 친화성 족문 ( neurotrophic footprint ) 내 표면 - 노출 아미노산 잔기 를 강조 하 는 AAV 1 RX 캡시드 표면 의 입체 로드맵 투영도 ( stereographic roadmap projection ) 를 작성 했 다 .