특정 한 다른 구 현예 에서 , 변형 된 바실 러스 세포 는 전술 한 본 개시 의 유전자 중 적어도 하나 의 발현 을 제거 하 거나 감소 시키 기 위한 유전자 결실 에 의해 작 제 된다 . 유전자 결실 기술 은 유전자 ( 들 ) 을 부분 적 으로 또는 완전 하 게 제거 함 으로써 이 들 의 발현 을 제거 하 거나 비 - 기능 적 ( 또는 활성 이 감소 된 ) 단백질 산물 의 발현 을 가능 하 게 한다 . 이러 한 방법 에 있 어서 , 유전자 ( 들 ) 의 결실 은 유전자 의 측면 에 위치 하 는 5 ’ 및 3 ’ 영역 을 인접 하 여 포함 하 도록 작 제 된 플라스미드 를 사용 하 는 상동성 재조합 에 의해 달성 될 수 있 다 . 인접 한 5 ’ 및 3 ’ 영역 은 , 예 를 들 어 , 플라스미드 가 세포 내 에 확립 될 수 있 게 하 는 허용 온도 에서 pE 194 와 같 은 온도 감수성 플라스미드 상 에서 제 2 선택 성 마커 와 조합 되 어 바실 러스 세포 내 로 도입 될 수 있 다 . 그런 다음 , 세포 를 비 - 허용 온도 로 이동 시켜 상동성 측면 영역 중 하나 에서 염색체 에 통합 된 플라스미드 를 갖 는 세포 를 선택 한다 . 플라스미드 의 통합 에 대한 선택 은 제 2 선택 성 마커 에 대한 선택 에 의해 수행 된다 . 통합 후 , 세포 를 선택 하 지 않 고 여러 세대 동안 허용 온도 로 세포 를 이동 시킴 으로써 제 2 상동성 측면 영역 에서 의 재조합 이벤트 가 자극 된다 . 세포 를 플 레이팅 하 여 단일 콜로니 를 수득 하 고 , 선택 성 마커 둘 다의 상실 에 대해 콜로니 를 검사 한다 ( 예 를 들 어 , Perego 의 1993 년 문헌 참조 ) . 따라서 , 당업자 는 ( 예 를 들 어 , rghR 1 , rghR 2 , abrB 1 , rpmJ , rpIM , BLi 00412 , rapK , phrK , BLi 00753 , yfjT , BLi 00828 , yhdX , yhzC , terf 2 , zosA , abbA , speG , yppF , BLi 02543 , mntR , BLi 02768 , sspA , BLi 03127 , BLi 03635 , mrgA , BLi 03644 , yvzC , spo 0 F , ywjG , ywq 12 , BLi 04199 , BLi 04200 , licT , bglH 및 bglP 유전자 ( 핵산 ) 서열 및 이 들 의 암호 화 된 단백질 서열 을 참조 함 으로써 ) 유전자 의 코딩 서열 및 / 또는 유전자 의 비 - 코딩 서열 에서 완전 결실 또는 부분 결실 에 적합 한 뉴클레오티드 영역 을 쉽 게 식별 할 수 있 다 .