민주당 은 민간 연구 기관 의 통폐합 에 정부 가 법 적 근거 없이 직접 관여 한 것 은 통합 이후 구조 조정 을 통해 세종연구소 의 진보 적 학자 들 의 입지 를 축소 시키 는 한편 , 세종재단 을 사실 상 흡수 통합 하 는 전경련 엔 재산 상 특혜 를 주 려는 것 아니 냐는 의심 을 하 고 있 다 . 현재 세종재단 은 올해 1 월 기준 395 억 여 원 의 기본 기금 과 이 기금 의 이자 수익 으로 조성 된 213 억 여 원 의 운영 기금 을 보유 하 고 있 다 . 또 경기도 성남 대왕 판교 에 있 는 세종재단 부지 의 시가 도 2100 억 여 원 에 이른다 . 이용준 당시 외교부 차관보 가 개입 한 통합 양해 각서 에 는 세종재단 부지 내 골프 연습장 임대 사업 까지 통합 보수 연구 법인 에 승계 하 는 내용 이 포함 된 것 으로 알려졌 다 .