당해 기술 분야 의 표준 적 인 방법 들 이 상동 관계 ( homology ) 를 결정 하 는 데 이용 될 수 있 다 . 예 를 들 어 , UWGCG 패키지 는 BESTFIT 프로그램 을 제공 하 는데 , 이것 은 상동 관계 를 계산 하 는 데 이용 될 수 있 으며 , 예 를 들 어 디폴트 세팅 에서 이용 될 수 있 다 ( Devereus et al ( 1984 ) Nucleic Acid Research 12 , p 387 - 395 ) . PILEUP 및 BLAST 알고리듬 은 ( ( 통상 적 으로 디폴트 세팅 에서 ) 등가 의 잔여물 또는 대응 의 시퀀스 들 을 식별 하 는 것 과 같이 ) 라인업 시퀀스 ( line up sequence ) 또는 상동 관계 를 계산 하 는 데 이용 될 수 있 는데 , 예 를 들 어 Altschul S . F . ( 1993 ) J Mol Evol 36 : 290 - 300 ; Altschul , S . F et al ( 1990 ) J Mol Biol 215 : 403 - 10 에 설명 된 바 와 같이 이용 될 수 있 다 . BLAST 분석 을 수행 하 기 위한 소프트웨어 는 생물학 정보 국가 센터 ( National Center for Biotechnology Information ) 을 통해서 공중 이 이용 할 수 있 다 ( http ;// www . ncbi . nlm . nih . gov / ) .