상기 프라이머 는 기본 성질 을 변화 시키 지 않 은 추가 의 특징 을 혼입 할 수 있 다 . 즉 핵산 서열 이 당해 분야 에 공지 된 많 은 수단 을 이용 하 여 변형 될 수 있 다 . 이러 한 변형 의 예 로 는 메틸화 , 캡 화 , 뉴클레오타이드 의 하나 이상 의 동족체 로 의 치환 및 포스 포 네이트 , 포스 포트리 에스테르 , 포스 포로 아미 데이트 또는 카바 메이트 등 의 하전 되 지 않 은 연결 체 나 포스 포로 티오 에이트 또는 포스 포로 디 티오 에이트 등 의 하전 된 연결 체로 의 뉴클레오타이드 의 변형 이 가능 하 다 . 또한 핵산 은 뉴클레아제 , 독소 , 항체 , 시 그날 펩타이드 , 폴리 L 리신 등 의 단백질 , 아크리딘 또는 프 소 랄 렌 등 의 삽 입제 , 금속 , 방사성 금속 , 철 산화 성 금속 등 의 킬레이트 화제 및 알킬화제 등 의 하나 이상 의 부가 적 인 공유 결합 된 잔기 를 가질 수 있 다 .