부위 - 특이 적 뉴클레아제 도메인 은 DNA 분자 내 의 특정 인식 서열 에 바인딩 하 고 이 를 인식 하 는 부위 - 특이 적 뉴클레아제 이 거나 , 이 로부터 유래 되 거나 , 또는 이 의 변이체 이 다 . 이 중 DNA 에 바인딩 시 , 촉매 활성 부위 - 특이 적 뉴클레아제 는 엄격 하 게 결정 된 방식 으로 DNA 스트랜드 중 하나 또는 둘 모두 를 절단 할 수 있 다 . 본원 에 정의 된 융합 단백질 의 뉴클레아제 도메인 은 하 기 본원 에 상세히 기재 된 바 와 같이 활성 적 이 거나 , 부분 적 으로 또는 전체 적 으로 촉매 적 으로 불활성 일 수 있 다 .