단백질 결합 작용기 는 단백질 의 활성 에 영향 을 미치 지 않 는 기능기 와 결합 할 수 있 는 작용기 를 선택 한다 . 단백질 의 아민 , 티 올 , 카르복실 레이트 , 하이드 록 실 , 알데하이드 중 선택 할 수 있 다 . 바람직 하 게 는 , 아민 그룹 과 결합 할 수 있 는 이 소티 오 시 아 네이트 , 아실 아자이드 , N - 하이드 록 시숙 신 이미드 , 설포닐 클로라이드 , 알데하이드 , 에폭사이드 로 구성 된 군 으로부터 선택 된다 . 이 중 빠르 고 강 하 게 단백질 과 결합 하 는 작용 기인 N - 하이드 록 시숙 신 이미드기 ( NHS ) 가 더욱 바람직 하 다 .