" 아미노산 또는 뉴클레오티드 염기 "" 위치 "" 는 N - 말단 ( 또는 5 '- 말단 ) 에 대한 위치 에 기초 하 여 참조 서열 에서 각 아미노산 ( 또는 뉴클레오티드 염기 ) 을 순차 적 으로 식별 하 는 숫자 로 표시 된다 . 최적 정렬 을 결정 할 때 고려 될 수 있 는 결실 ", 삽입 , 절두 , 융합 등 으로 인해 , 일반 적 으로 N - 말단 으로부터 단순히 계수 함 으로써 결정 된 테스트 서열 의 아미노산 잔기 번호 는 반드시 참조 서열 에서 상응 하 는 위치 의 번호 와 동일 하 지 는 않 을 것 이 다 . 예 를 들 어 , 변이체 가 정렬 된 참조 서열 과 비교 하 여 결실 을 가질 경우 , 변이체 에 는 결실 부위 에서 참조 서열 의 위치 에 상응 하 는 아미노산 이 없 을 것 이 다 . 정렬 된 참조 서열 에 삽입 이 있 을 경우 , 그 삽입 은 참조 서열 의 넘버링 된 아미노산 위치 에 상응 하 지 않 을 것 이 다 . 절두 또는 융합 일 경우 , 참조 또는 정렬 된 서열 에 는 상응 하 는 서열 의 어떤 아미노산 에 도 상응 하 지 않 는 아미노산 의 스트레치 가 있 을 수 있 다 .