결정 이 수득 되 면 , 구조 를 공지 된 X 선 회절 기술 에 의해 해석 할 수 있 다 . 다수 의 기술 은 화학 적 으로 변형 된 결정 , 예컨대 상 을 근사 화 시키 기 위한 중원 자 유도체 화 에 의해 변형 된 것 을 이용 한다 . 실제로 , 결정 은 중금속 원자 염 또는 유기 금속 화합물 , 예 를 들 어 납 클로라이드 , 금 티오 말 레이트 , 티메로살 또는 우라닐 아세테이트 ( 이 는 결정 을 통해 확산 될 수 있 음 ) 를 함유 하 는 용액 에 침치 되 고 , 단백질 의 표면 에 결합 한다 . 이어서 , 결합 된 중금속 원자 ( 들 ) 의 위치 ( 들 ) 는 침지 된 결정 의 X 선 회절 분석 에 의해 결정 될 수 있 다 . 결정 의 원자 ( 산란 중심 ) 에 의해 X 선 의 단색 빔 의 회절 에서 수득 한 패턴 은 수학 방정식 으로 해석 하 여 수학 적 좌표 를 제공 할 수 있 다 . 회절 데이터 를 이용 하 여 결정 의 반복 단위 의 전자 밀도 지도 를 계산 한다 . 상 정보 를 수득 하 는 또 다른 방법 은 분자 대체로 공지 된 기술 을 이용 하 는 것 이 다 . 이러 한 방법 에서 , 회전 및 번역 알고리즘 은 관련 된 구조 로부터 유래 된 검색 모델 에 적용 되 어 관심 단백질 에 대한 대략 적 인 배향 을 생성 한다 ( 문헌 [ Rossmann , ( 1990 ) Acta Crystals A 46 , 73 - 82 ] 참조 ) . 전자 밀도 지도 는 결정 의 단위 셀 내 에 개별 원자 의 위치 를 확립 하 는 데 사용 된다 ( 문헌 [ Blundel et al . , ( 1976 ) Protein Crystallography , Academic Press ] ) .