2 차원 전기영동 의 유용 성 은 낮 은 검출 민감 도 ; 단백질 용해도 ( protein solubility ) , 전하 ( charge ) 및 소수성 ( hydrophobicity ) 에 대한 문제점 ; 겔 재 생력 ( gel reproducibility ) ; 및 다중 단백질 을 나타내 는 단일 스팟 ( spot ) 의 가능 성 에 의해 제한 된다 . 질량 분석 에 대하 여 , 사용 된 포맷 에 따라 , 제한 사항 은 샘플 처리 및 분리 , 존재비 가 낮 은 ( low abundance ) 단백질 에 대한 민감 도 , 신호 대 잡음 비 ( signal to noise ) 에 대한 고려 및 검출 된 단백질 의 즉시 확인 불 가능 을 중심 으로 한다 . 바이오 마커 발굴 에 대한 면역학 적 검정 접근 법 에서 의 제한 사항 은 다수 의 분석 물질 을 측정 하 기 위한 항체 - 기반 다중 분석 의 불 가능 에 중점 을 두 고 있 다 . 어떤 것 은 고 성능 항체 의 배열 을 간단 하 게 찍 을 수 있 고 , 샌드위치 검정 을 사용 하 지 않 고 그 항체 들 에 결합 한 분석 물질 들 을 측정 할 수 있 다 . ( 이것 은 유기체 또는 세포 에서 의 모든 DNA 또는 RNA 서열 을 혼성 화 ( hybridization ) 에 의해 측정 하 기 위하 여 전체 게놈 의 핵산 서열 을 사용 하 는 것 의 형식 적 인 등가물 일 수 있 다 . 혼 성 화 실험 은 혼성 화 가 확인 을 위한 엄격 한 테스 트일 수 있 기 때문 에 효과 가 있 다 . 그 매트릭스 들 에서 의 단백질 앙상블 ( protein ensemble ) 은 극도 로 서로 다른 풍부 함 ( abundance ) 을 가지 고 있 기 때문 에 , 매우 우수 한 항체 도 혈액 또는 심지어 세포 추출물 에 따라 작용 하 기 위한 그것 들 의 결합 파트너 를 선별 할 만큼 충분히 엄격 하 지 않 다 . ) 따라서 , 바이오 마커 발굴 을 위하 여 면역학 적 검정 에 기초 한 접근 법 과 함께 다른 접근 법 을 사용 하 여야만 한다 - 분석 물질 이 정말로 바이오 마커 인지 를 결정 하 기 위하 여 , 많 은 분석 물질 을 동시 에 측정 하 는데 충분 한 엄격 함 을 얻 기 위한 다중 ELISA 분석법 ( 즉 , 샌드위치 면역학 적 검정 ) 을 사용 할 필요 가 있 다 . 샌드위치 면역학 적 검정 ( sandwiches immunoassays ) 은 높 은 함량 을 측정 할 수 없 으므로 , 엄격 한 샌드위치 면역학 적 검정 을 사용 하 는 바이오 마커 발굴 은 표준 어레이 포맷 을 사용 하 는 것 이 불 가능 하 다 . 마지막 으로 , 항체 시약 ( antibody reagents ) 은 많 은 변수 ( variability ) 와 시약 불안정성 ( instability ) 에 영향 을 받 는다 . 단백질 바이오 마커 발굴 을 위한 즉석 플랫폼 ( instant platform ) 은 이러 한 문제점 을 극복 한다 .