본원 에서 사용 되 는 바 와 같이 , " 제시 된 아미노산 또는 폴리뉴클레오티드 서열 의 넘버링 측면 에서 사용 될 때 ""~ 에 상응 하 는 """," ""~ 를 참조 하 여 "" 및 ""~ 에 대하 여 "" 는 제시 된 아미노산 또는 폴리뉴클레오티드 서열 이 참조 서열 과 비 교시 에 구체 화 된 참조 서열 의 잔기 의 넘버링 을 지칭 한다 . 달리 말 하 면 ", 제시 된 중합체 의 잔기 번호 또는 잔기 위치 는 제시 된 아미노산 또는 폴리뉴클레오티드 서열 내 의 잔기 의 실제 수치 위치 보다 는 참조 서열 과 관련 하 여 지정 된다 . 예 를 들 면 , 제시 된 아미노산 서열 , 예컨대 조작 된 글 리코 실 트랜스퍼 라 제 의 아미노산 서열 은 2 개 의 서열 사이 에 잔기 대응 을 최적 화 하 도록 갭 을 도입 함 으로써 참조 서열 에 정렬 시킬 수 있 다 . 이러 한 경우 , 갭 이 존재 하 더라도 , 제시 된 아미노산 또는 폴리뉴클레오티드 서열 내 의 잔기 의 넘버링 은 정렬 되 는 참조 서열 과 관련 하 여 이루어진다 .