상기 단백질 정보 데이터베이스 ( 140 ) 로부터 한 종 의 소스 단백질 들 과 관련 성 이 높 은 이종 단백질 들 을 다른 종 의 전체 이종 단백질 들 로부터 필터링 하 는 단계 를 포함 하 는 한 종 의 소스 단백질 들 및 하나 이상 의 다른 종 의 이종 단백질 들 사이 의 하나 이상 의 상동 관계 를 생성 하 는 상동 관계 생 성부 ( 110 ) ; 상기 생성 된 단백질 상동 관계 를 이용 하 여 특정 소스 단백질 상호 작용 관계 에 대응 하 는 하나 이상 의 이종 단백질 상호 작용 관계 를 생성 하 는 상호 작용 관계 생 성부 ( 120 ) ; 및 상기 단백질 상호 작용 관계 데이터베이스 를 이용 하 여 상기 생성 된 하나 이상 의 이종 단백질 상호 작용 관계 가 상기 하나 이상 의 다른 종 에 존재 하 는지 여부 를 평가 하 는 상호 작용 관계 평가 부 ( 130 ) ; 를 포함 한다 .