형광 검출 은 직접 적 이 며 , 수행 하 기 편리 한 방법 이 다 . 고체 지지물 위 에서 형광 라벨 을 포획 ( capture ) 하 기 위해서 , 또는 젤 또는 모세관 전기영동 을 통해 라벨 로부터 형광 생성물 을 분리 하 기 위하 여 형광 검출 을 사용 하 는 것 을 제외 하 고는 , 형광 검출 은 이중 나선 핵산 에서 형광 을 나타내 는 핵산 인터 컬 레이팅 염료 ( DNA intercalating dye ) 을 가진 이중 나선 핵산 의 형성 을 모니터 하 는 데 사용 할 수 있 다 . 직접 적 인 형광 검출 은 어느 범위 까지 는 매우 다양 하 게 사용 할 수 있 다 . 그러나 형광 라벨 을 사용 할 때 반응 생성물 의 정제 · 분리 에 대한 필요 성 및 인터 컬 레이팅 염료 를 사용 할 때 비 특이 적 이중 나선 핵산 종 ( species ) 에 의한 간섭 ( interference ) 은 직접 적 인 형광 검출 의 단점 으로 지적 되 고 있 다 .